Protein–RNA interactions for Protein: Q6VSS7

Rhox8, Reproductive homeobox 8, mousemouse

Predictions only

Length 320 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhox8Q6VSS7 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.71■■■■□ 3.47
Rhox8Q6VSS7 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC36.7■■■■□ 3.47
Rhox8Q6VSS7 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.7■■■■□ 3.47
Rhox8Q6VSS7 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.7■■■■□ 3.47
Rhox8Q6VSS7 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC36.7■■■■□ 3.47
Rhox8Q6VSS7 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.7■■■■□ 3.47
Rhox8Q6VSS7 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.7■■■■□ 3.47
Rhox8Q6VSS7 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC36.69■■■■□ 3.46
Rhox8Q6VSS7 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.69■■■■□ 3.46
Rhox8Q6VSS7 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.69■■■■□ 3.46
Rhox8Q6VSS7 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.69■■■■□ 3.46
Rhox8Q6VSS7 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.69■■■■□ 3.46
Rhox8Q6VSS7 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.69■■■■□ 3.46
Rhox8Q6VSS7 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.68■■■■□ 3.46
Rhox8Q6VSS7 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.68■■■■□ 3.46
Rhox8Q6VSS7 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.68■■■■□ 3.46
Rhox8Q6VSS7 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.68■■■■□ 3.46
Rhox8Q6VSS7 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.68■■■■□ 3.46
Rhox8Q6VSS7 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC36.67■■■■□ 3.46
Rhox8Q6VSS7 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.67■■■■□ 3.46
Rhox8Q6VSS7 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.67■■■■□ 3.46
Rhox8Q6VSS7 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC36.67■■■■□ 3.46
Rhox8Q6VSS7 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC36.67■■■■□ 3.46
Rhox8Q6VSS7 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.67■■■■□ 3.46
Rhox8Q6VSS7 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.67■■■■□ 3.46
Rhox8Q6VSS7 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.66■■■■□ 3.46
Rhox8Q6VSS7 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.66■■■■□ 3.46
Rhox8Q6VSS7 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.66■■■■□ 3.46
Rhox8Q6VSS7 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.66■■■■□ 3.46
Rhox8Q6VSS7 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC36.66■■■■□ 3.46
Rhox8Q6VSS7 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC36.66■■■■□ 3.46
Rhox8Q6VSS7 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.66■■■■□ 3.46
Rhox8Q6VSS7 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC36.66■■■■□ 3.46
Rhox8Q6VSS7 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.66■■■■□ 3.46
Rhox8Q6VSS7 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.66■■■■□ 3.46
Rhox8Q6VSS7 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.65■■■■□ 3.46
Rhox8Q6VSS7 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.65■■■■□ 3.46
Rhox8Q6VSS7 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC36.65■■■■□ 3.46
Rhox8Q6VSS7 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC36.65■■■■□ 3.46
Rhox8Q6VSS7 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC36.65■■■■□ 3.46
Rhox8Q6VSS7 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.64■■■■□ 3.46
Rhox8Q6VSS7 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC36.64■■■■□ 3.46
Rhox8Q6VSS7 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC36.64■■■■□ 3.46
Rhox8Q6VSS7 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.63■■■■□ 3.46
Rhox8Q6VSS7 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC36.63■■■■□ 3.45
Rhox8Q6VSS7 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC36.63■■■■□ 3.45
Rhox8Q6VSS7 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.63■■■■□ 3.45
Rhox8Q6VSS7 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC36.63■■■■□ 3.45
Rhox8Q6VSS7 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.63■■■■□ 3.45
Rhox8Q6VSS7 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC36.63■■■■□ 3.45
Rhox8Q6VSS7 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.62■■■■□ 3.45
Rhox8Q6VSS7 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.62■■■■□ 3.45
Rhox8Q6VSS7 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.62■■■■□ 3.45
Rhox8Q6VSS7 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.62■■■■□ 3.45
Rhox8Q6VSS7 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC36.62■■■■□ 3.45
Rhox8Q6VSS7 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC36.62■■■■□ 3.45
Rhox8Q6VSS7 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC36.62■■■■□ 3.45
Rhox8Q6VSS7 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.61■■■■□ 3.45
Rhox8Q6VSS7 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.61■■■■□ 3.45
Rhox8Q6VSS7 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.61■■■■□ 3.45
Rhox8Q6VSS7 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.61■■■■□ 3.45
Rhox8Q6VSS7 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.61■■■■□ 3.45
Rhox8Q6VSS7 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.6■■■■□ 3.45
Rhox8Q6VSS7 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.6■■■■□ 3.45
Rhox8Q6VSS7 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.6■■■■□ 3.45
Rhox8Q6VSS7 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.6■■■■□ 3.45
Rhox8Q6VSS7 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC36.6■■■■□ 3.45
Rhox8Q6VSS7 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.6■■■■□ 3.45
Rhox8Q6VSS7 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC36.6■■■■□ 3.45
Rhox8Q6VSS7 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.6■■■■□ 3.45
Rhox8Q6VSS7 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC36.6■■■■□ 3.45
Rhox8Q6VSS7 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC36.59■■■■□ 3.45
Rhox8Q6VSS7 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.59■■■■□ 3.45
Rhox8Q6VSS7 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC36.59■■■■□ 3.45
Rhox8Q6VSS7 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.59■■■■□ 3.45
Rhox8Q6VSS7 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC36.59■■■■□ 3.45
Rhox8Q6VSS7 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.59■■■■□ 3.45
Rhox8Q6VSS7 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.59■■■■□ 3.45
Rhox8Q6VSS7 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.59■■■■□ 3.45
Rhox8Q6VSS7 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.59■■■■□ 3.45
Rhox8Q6VSS7 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.59■■■■□ 3.45
Rhox8Q6VSS7 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC36.58■■■■□ 3.45
Rhox8Q6VSS7 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.58■■■■□ 3.45
Rhox8Q6VSS7 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC36.58■■■■□ 3.45
Rhox8Q6VSS7 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.58■■■■□ 3.45
Rhox8Q6VSS7 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.57■■■■□ 3.44
Rhox8Q6VSS7 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.56■■■■□ 3.44
Rhox8Q6VSS7 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
Rhox8Q6VSS7 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC36.56■■■■□ 3.44
Rhox8Q6VSS7 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC36.56■■■■□ 3.44
Rhox8Q6VSS7 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
Rhox8Q6VSS7 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
Rhox8Q6VSS7 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC36.55■■■■□ 3.44
Rhox8Q6VSS7 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.55■■■■□ 3.44
Rhox8Q6VSS7 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.55■■■■□ 3.44
Rhox8Q6VSS7 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.55■■■■□ 3.44
Rhox8Q6VSS7 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.54■■■■□ 3.44
Rhox8Q6VSS7 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.54■■■■□ 3.44
Rhox8Q6VSS7 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC36.54■■■■□ 3.44
Rhox8Q6VSS7 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC36.54■■■■□ 3.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms