Protein–RNA interactions for Protein: Q6VH22

Ift172, Intraflagellar transport protein 172 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,749 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ift172Q6VH22 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Ift172Q6VH22 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Ift172Q6VH22 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Ift172Q6VH22 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Ift172Q6VH22 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Ift172Q6VH22 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Ift172Q6VH22 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Ift172Q6VH22 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Ift172Q6VH22 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
Ift172Q6VH22 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
Ift172Q6VH22 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Ift172Q6VH22 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Ift172Q6VH22 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Ift172Q6VH22 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Ift172Q6VH22 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Ift172Q6VH22 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Ift172Q6VH22 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Ift172Q6VH22 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Ift172Q6VH22 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Ift172Q6VH22 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Ift172Q6VH22 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Ift172Q6VH22 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Ift172Q6VH22 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
Ift172Q6VH22 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC26.95■■□□□ 1.91
Ift172Q6VH22 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Ift172Q6VH22 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Ift172Q6VH22 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Ift172Q6VH22 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Ift172Q6VH22 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Ift172Q6VH22 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Ift172Q6VH22 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Ift172Q6VH22 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
Ift172Q6VH22 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Ift172Q6VH22 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Ift172Q6VH22 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Ift172Q6VH22 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Ift172Q6VH22 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
Ift172Q6VH22 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
Ift172Q6VH22 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Ift172Q6VH22 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Ift172Q6VH22 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Ift172Q6VH22 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Ift172Q6VH22 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Ift172Q6VH22 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Ift172Q6VH22 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Ift172Q6VH22 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
Ift172Q6VH22 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Ift172Q6VH22 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Ift172Q6VH22 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Ift172Q6VH22 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Ift172Q6VH22 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Ift172Q6VH22 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Ift172Q6VH22 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Ift172Q6VH22 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Ift172Q6VH22 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Ift172Q6VH22 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Ift172Q6VH22 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Ift172Q6VH22 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Ift172Q6VH22 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Ift172Q6VH22 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Ift172Q6VH22 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Ift172Q6VH22 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Ift172Q6VH22 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Ift172Q6VH22 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
Ift172Q6VH22 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Ift172Q6VH22 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Ift172Q6VH22 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
Ift172Q6VH22 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Ift172Q6VH22 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Ift172Q6VH22 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Ift172Q6VH22 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Ift172Q6VH22 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Ift172Q6VH22 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
Ift172Q6VH22 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Ift172Q6VH22 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Ift172Q6VH22 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Ift172Q6VH22 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Ift172Q6VH22 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Ift172Q6VH22 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Ift172Q6VH22 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Ift172Q6VH22 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Ift172Q6VH22 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Ift172Q6VH22 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Ift172Q6VH22 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Ift172Q6VH22 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Ift172Q6VH22 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Ift172Q6VH22 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Ift172Q6VH22 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Ift172Q6VH22 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Ift172Q6VH22 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Ift172Q6VH22 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Ift172Q6VH22 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Ift172Q6VH22 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Ift172Q6VH22 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Ift172Q6VH22 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Ift172Q6VH22 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Ift172Q6VH22 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Ift172Q6VH22 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Ift172Q6VH22 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Ift172Q6VH22 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14 ms