Protein–RNA interactions for Protein: Q6UQ17

Atp8b3, Phospholipid-transporting ATPase IK, mousemouse

Predictions only

Length 1,335 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp8b3Q6UQ17 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Atp8b3Q6UQ17 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Atp8b3Q6UQ17 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Atp8b3Q6UQ17 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Atp8b3Q6UQ17 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Atp8b3Q6UQ17 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Atp8b3Q6UQ17 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Atp8b3Q6UQ17 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Atp8b3Q6UQ17 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Atp8b3Q6UQ17 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Atp8b3Q6UQ17 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Atp8b3Q6UQ17 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Atp8b3Q6UQ17 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Atp8b3Q6UQ17 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Atp8b3Q6UQ17 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Atp8b3Q6UQ17 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Atp8b3Q6UQ17 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Atp8b3Q6UQ17 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Atp8b3Q6UQ17 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Atp8b3Q6UQ17 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Atp8b3Q6UQ17 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Atp8b3Q6UQ17 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Atp8b3Q6UQ17 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Atp8b3Q6UQ17 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Atp8b3Q6UQ17 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Atp8b3Q6UQ17 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Atp8b3Q6UQ17 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Atp8b3Q6UQ17 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Atp8b3Q6UQ17 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Atp8b3Q6UQ17 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Atp8b3Q6UQ17 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Atp8b3Q6UQ17 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Atp8b3Q6UQ17 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Atp8b3Q6UQ17 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Atp8b3Q6UQ17 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Atp8b3Q6UQ17 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Atp8b3Q6UQ17 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Atp8b3Q6UQ17 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Atp8b3Q6UQ17 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Atp8b3Q6UQ17 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Atp8b3Q6UQ17 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Atp8b3Q6UQ17 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Atp8b3Q6UQ17 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Atp8b3Q6UQ17 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Atp8b3Q6UQ17 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Atp8b3Q6UQ17 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Atp8b3Q6UQ17 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Atp8b3Q6UQ17 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
Atp8b3Q6UQ17 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Atp8b3Q6UQ17 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Atp8b3Q6UQ17 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Atp8b3Q6UQ17 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Atp8b3Q6UQ17 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Atp8b3Q6UQ17 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Atp8b3Q6UQ17 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Atp8b3Q6UQ17 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Atp8b3Q6UQ17 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Atp8b3Q6UQ17 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Atp8b3Q6UQ17 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Atp8b3Q6UQ17 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Atp8b3Q6UQ17 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Atp8b3Q6UQ17 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Atp8b3Q6UQ17 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Atp8b3Q6UQ17 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Atp8b3Q6UQ17 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Atp8b3Q6UQ17 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Atp8b3Q6UQ17 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Atp8b3Q6UQ17 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Atp8b3Q6UQ17 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Atp8b3Q6UQ17 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Atp8b3Q6UQ17 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Atp8b3Q6UQ17 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Atp8b3Q6UQ17 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Atp8b3Q6UQ17 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Atp8b3Q6UQ17 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Atp8b3Q6UQ17 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Atp8b3Q6UQ17 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Atp8b3Q6UQ17 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Atp8b3Q6UQ17 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Atp8b3Q6UQ17 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Atp8b3Q6UQ17 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Atp8b3Q6UQ17 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Atp8b3Q6UQ17 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Atp8b3Q6UQ17 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Atp8b3Q6UQ17 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Atp8b3Q6UQ17 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Atp8b3Q6UQ17 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Atp8b3Q6UQ17 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Atp8b3Q6UQ17 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Atp8b3Q6UQ17 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Atp8b3Q6UQ17 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Atp8b3Q6UQ17 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Atp8b3Q6UQ17 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Atp8b3Q6UQ17 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Atp8b3Q6UQ17 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Atp8b3Q6UQ17 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Atp8b3Q6UQ17 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Atp8b3Q6UQ17 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Atp8b3Q6UQ17 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Atp8b3Q6UQ17 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms