Protein–RNA interactions for Protein: Q6PHS6

Snx13, Sorting nexin-13, mousemouse

Predictions only

Length 957 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx13Q6PHS6 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Snx13Q6PHS6 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Snx13Q6PHS6 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Snx13Q6PHS6 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Snx13Q6PHS6 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Snx13Q6PHS6 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Snx13Q6PHS6 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Snx13Q6PHS6 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Snx13Q6PHS6 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Snx13Q6PHS6 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Snx13Q6PHS6 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Snx13Q6PHS6 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Snx13Q6PHS6 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Snx13Q6PHS6 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Snx13Q6PHS6 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Snx13Q6PHS6 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Snx13Q6PHS6 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Snx13Q6PHS6 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Snx13Q6PHS6 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Snx13Q6PHS6 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Snx13Q6PHS6 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Snx13Q6PHS6 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Snx13Q6PHS6 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Snx13Q6PHS6 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Snx13Q6PHS6 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Snx13Q6PHS6 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Snx13Q6PHS6 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Snx13Q6PHS6 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Snx13Q6PHS6 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Snx13Q6PHS6 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Snx13Q6PHS6 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Snx13Q6PHS6 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Snx13Q6PHS6 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Snx13Q6PHS6 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Snx13Q6PHS6 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Snx13Q6PHS6 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Snx13Q6PHS6 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Snx13Q6PHS6 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Snx13Q6PHS6 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Snx13Q6PHS6 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Snx13Q6PHS6 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Snx13Q6PHS6 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Snx13Q6PHS6 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Snx13Q6PHS6 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Snx13Q6PHS6 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Snx13Q6PHS6 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Snx13Q6PHS6 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Snx13Q6PHS6 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Snx13Q6PHS6 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Snx13Q6PHS6 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Snx13Q6PHS6 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Snx13Q6PHS6 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Snx13Q6PHS6 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Snx13Q6PHS6 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Snx13Q6PHS6 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Snx13Q6PHS6 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Snx13Q6PHS6 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Snx13Q6PHS6 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Snx13Q6PHS6 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Snx13Q6PHS6 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Snx13Q6PHS6 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Snx13Q6PHS6 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Snx13Q6PHS6 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Snx13Q6PHS6 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Snx13Q6PHS6 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Snx13Q6PHS6 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Snx13Q6PHS6 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Snx13Q6PHS6 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Snx13Q6PHS6 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Snx13Q6PHS6 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Snx13Q6PHS6 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Snx13Q6PHS6 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Snx13Q6PHS6 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Snx13Q6PHS6 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Snx13Q6PHS6 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Snx13Q6PHS6 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Snx13Q6PHS6 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Snx13Q6PHS6 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Snx13Q6PHS6 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Snx13Q6PHS6 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Snx13Q6PHS6 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Snx13Q6PHS6 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Snx13Q6PHS6 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Snx13Q6PHS6 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Snx13Q6PHS6 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Snx13Q6PHS6 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Snx13Q6PHS6 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Snx13Q6PHS6 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Snx13Q6PHS6 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Snx13Q6PHS6 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Snx13Q6PHS6 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Snx13Q6PHS6 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Snx13Q6PHS6 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Snx13Q6PHS6 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Snx13Q6PHS6 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Snx13Q6PHS6 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Snx13Q6PHS6 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Snx13Q6PHS6 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Snx13Q6PHS6 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Snx13Q6PHS6 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms