Protein–RNA interactions for Protein: Q6PGE4

Znf316, Zinc finger protein 316, mousemouse

Predictions only

Length 1,016 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf316Q6PGE4 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Znf316Q6PGE4 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Znf316Q6PGE4 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Znf316Q6PGE4 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Znf316Q6PGE4 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Znf316Q6PGE4 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
Znf316Q6PGE4 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Znf316Q6PGE4 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Znf316Q6PGE4 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Znf316Q6PGE4 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Znf316Q6PGE4 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Znf316Q6PGE4 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Znf316Q6PGE4 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Znf316Q6PGE4 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
Znf316Q6PGE4 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Znf316Q6PGE4 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Znf316Q6PGE4 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Znf316Q6PGE4 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Znf316Q6PGE4 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Znf316Q6PGE4 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Znf316Q6PGE4 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Znf316Q6PGE4 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Znf316Q6PGE4 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Znf316Q6PGE4 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Znf316Q6PGE4 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Znf316Q6PGE4 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Znf316Q6PGE4 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Znf316Q6PGE4 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Znf316Q6PGE4 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Znf316Q6PGE4 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Znf316Q6PGE4 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
Znf316Q6PGE4 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Znf316Q6PGE4 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Znf316Q6PGE4 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Znf316Q6PGE4 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Znf316Q6PGE4 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Znf316Q6PGE4 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Znf316Q6PGE4 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Znf316Q6PGE4 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Znf316Q6PGE4 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Znf316Q6PGE4 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Znf316Q6PGE4 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Znf316Q6PGE4 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Znf316Q6PGE4 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Znf316Q6PGE4 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Znf316Q6PGE4 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Znf316Q6PGE4 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Znf316Q6PGE4 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Znf316Q6PGE4 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Znf316Q6PGE4 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Znf316Q6PGE4 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Znf316Q6PGE4 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Znf316Q6PGE4 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Znf316Q6PGE4 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Znf316Q6PGE4 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Znf316Q6PGE4 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Znf316Q6PGE4 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Znf316Q6PGE4 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Znf316Q6PGE4 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Znf316Q6PGE4 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
Znf316Q6PGE4 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Znf316Q6PGE4 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
Znf316Q6PGE4 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Znf316Q6PGE4 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Znf316Q6PGE4 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
Znf316Q6PGE4 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Znf316Q6PGE4 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Znf316Q6PGE4 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Znf316Q6PGE4 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Znf316Q6PGE4 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Znf316Q6PGE4 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Znf316Q6PGE4 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Znf316Q6PGE4 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Znf316Q6PGE4 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Znf316Q6PGE4 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Znf316Q6PGE4 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Znf316Q6PGE4 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Znf316Q6PGE4 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Znf316Q6PGE4 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Znf316Q6PGE4 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Znf316Q6PGE4 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Znf316Q6PGE4 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Znf316Q6PGE4 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
Znf316Q6PGE4 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Znf316Q6PGE4 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Znf316Q6PGE4 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Znf316Q6PGE4 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Znf316Q6PGE4 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
Znf316Q6PGE4 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Znf316Q6PGE4 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Znf316Q6PGE4 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Znf316Q6PGE4 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
Znf316Q6PGE4 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Znf316Q6PGE4 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Znf316Q6PGE4 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Znf316Q6PGE4 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Znf316Q6PGE4 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Znf316Q6PGE4 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Znf316Q6PGE4 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Znf316Q6PGE4 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms