Protein–RNA interactions for Protein: Q6PEM6

Gramd2b, GRAM domain-containing protein 2B, mousemouse

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gramd2bQ6PEM6 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gramd2bQ6PEM6 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gramd2bQ6PEM6 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Gramd2bQ6PEM6 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Gramd2bQ6PEM6 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gramd2bQ6PEM6 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gramd2bQ6PEM6 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gramd2bQ6PEM6 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gramd2bQ6PEM6 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gramd2bQ6PEM6 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gramd2bQ6PEM6 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gramd2bQ6PEM6 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gramd2bQ6PEM6 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gramd2bQ6PEM6 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gramd2bQ6PEM6 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gramd2bQ6PEM6 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gramd2bQ6PEM6 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gramd2bQ6PEM6 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gramd2bQ6PEM6 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gramd2bQ6PEM6 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gramd2bQ6PEM6 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gramd2bQ6PEM6 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gramd2bQ6PEM6 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gramd2bQ6PEM6 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gramd2bQ6PEM6 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gramd2bQ6PEM6 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gramd2bQ6PEM6 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gramd2bQ6PEM6 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gramd2bQ6PEM6 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gramd2bQ6PEM6 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gramd2bQ6PEM6 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gramd2bQ6PEM6 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gramd2bQ6PEM6 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gramd2bQ6PEM6 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gramd2bQ6PEM6 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gramd2bQ6PEM6 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gramd2bQ6PEM6 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gramd2bQ6PEM6 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gramd2bQ6PEM6 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gramd2bQ6PEM6 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gramd2bQ6PEM6 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gramd2bQ6PEM6 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Gramd2bQ6PEM6 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gramd2bQ6PEM6 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gramd2bQ6PEM6 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gramd2bQ6PEM6 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gramd2bQ6PEM6 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Gramd2bQ6PEM6 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Gramd2bQ6PEM6 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gramd2bQ6PEM6 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gramd2bQ6PEM6 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gramd2bQ6PEM6 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Gramd2bQ6PEM6 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gramd2bQ6PEM6 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gramd2bQ6PEM6 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gramd2bQ6PEM6 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gramd2bQ6PEM6 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gramd2bQ6PEM6 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gramd2bQ6PEM6 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gramd2bQ6PEM6 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gramd2bQ6PEM6 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gramd2bQ6PEM6 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gramd2bQ6PEM6 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Gramd2bQ6PEM6 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gramd2bQ6PEM6 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gramd2bQ6PEM6 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gramd2bQ6PEM6 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gramd2bQ6PEM6 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gramd2bQ6PEM6 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gramd2bQ6PEM6 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gramd2bQ6PEM6 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gramd2bQ6PEM6 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gramd2bQ6PEM6 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gramd2bQ6PEM6 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Gramd2bQ6PEM6 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Gramd2bQ6PEM6 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Gramd2bQ6PEM6 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gramd2bQ6PEM6 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gramd2bQ6PEM6 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gramd2bQ6PEM6 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gramd2bQ6PEM6 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Gramd2bQ6PEM6 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gramd2bQ6PEM6 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gramd2bQ6PEM6 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gramd2bQ6PEM6 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gramd2bQ6PEM6 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gramd2bQ6PEM6 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gramd2bQ6PEM6 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gramd2bQ6PEM6 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gramd2bQ6PEM6 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gramd2bQ6PEM6 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gramd2bQ6PEM6 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gramd2bQ6PEM6 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gramd2bQ6PEM6 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gramd2bQ6PEM6 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gramd2bQ6PEM6 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gramd2bQ6PEM6 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Gramd2bQ6PEM6 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Gramd2bQ6PEM6 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Gramd2bQ6PEM6 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.5 ms