Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDK8

Dtx4, E3 ubiquitin-protein ligase DTX4, mousemouse

Predictions only

Length 616 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dtx4Q6PDK8 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Dtx4Q6PDK8 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Dtx4Q6PDK8 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Dtx4Q6PDK8 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Dtx4Q6PDK8 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Dtx4Q6PDK8 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Dtx4Q6PDK8 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Dtx4Q6PDK8 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Dtx4Q6PDK8 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Dtx4Q6PDK8 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Dtx4Q6PDK8 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Dtx4Q6PDK8 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Dtx4Q6PDK8 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Dtx4Q6PDK8 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Dtx4Q6PDK8 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Dtx4Q6PDK8 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Dtx4Q6PDK8 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Dtx4Q6PDK8 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Dtx4Q6PDK8 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Dtx4Q6PDK8 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Dtx4Q6PDK8 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Dtx4Q6PDK8 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Dtx4Q6PDK8 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Dtx4Q6PDK8 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Dtx4Q6PDK8 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Dtx4Q6PDK8 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Dtx4Q6PDK8 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Dtx4Q6PDK8 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Dtx4Q6PDK8 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Dtx4Q6PDK8 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Dtx4Q6PDK8 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Dtx4Q6PDK8 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Dtx4Q6PDK8 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Dtx4Q6PDK8 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Dtx4Q6PDK8 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Dtx4Q6PDK8 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Dtx4Q6PDK8 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Dtx4Q6PDK8 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Dtx4Q6PDK8 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Dtx4Q6PDK8 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Dtx4Q6PDK8 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Dtx4Q6PDK8 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Dtx4Q6PDK8 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Dtx4Q6PDK8 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Dtx4Q6PDK8 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Dtx4Q6PDK8 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Dtx4Q6PDK8 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Dtx4Q6PDK8 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Dtx4Q6PDK8 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Dtx4Q6PDK8 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Dtx4Q6PDK8 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Dtx4Q6PDK8 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Dtx4Q6PDK8 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Dtx4Q6PDK8 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Dtx4Q6PDK8 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Dtx4Q6PDK8 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Dtx4Q6PDK8 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Dtx4Q6PDK8 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Dtx4Q6PDK8 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Dtx4Q6PDK8 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Dtx4Q6PDK8 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Dtx4Q6PDK8 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Dtx4Q6PDK8 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Dtx4Q6PDK8 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Dtx4Q6PDK8 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Dtx4Q6PDK8 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Dtx4Q6PDK8 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Dtx4Q6PDK8 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Dtx4Q6PDK8 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Dtx4Q6PDK8 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Dtx4Q6PDK8 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Dtx4Q6PDK8 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Dtx4Q6PDK8 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Dtx4Q6PDK8 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Dtx4Q6PDK8 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Dtx4Q6PDK8 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Dtx4Q6PDK8 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Dtx4Q6PDK8 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Dtx4Q6PDK8 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Dtx4Q6PDK8 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Dtx4Q6PDK8 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Dtx4Q6PDK8 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Dtx4Q6PDK8 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Dtx4Q6PDK8 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Dtx4Q6PDK8 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Dtx4Q6PDK8 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Dtx4Q6PDK8 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Dtx4Q6PDK8 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Dtx4Q6PDK8 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Dtx4Q6PDK8 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Dtx4Q6PDK8 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Dtx4Q6PDK8 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Dtx4Q6PDK8 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Dtx4Q6PDK8 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Dtx4Q6PDK8 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Dtx4Q6PDK8 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Dtx4Q6PDK8 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Dtx4Q6PDK8 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Dtx4Q6PDK8 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Dtx4Q6PDK8 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.1 ms