Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDG5

Smarcc2, SWI/SNF complex subunit SMARCC2, mousemouse

Predictions only

Length 1,213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarcc2Q6PDG5 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Smarcc2Q6PDG5 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Smarcc2Q6PDG5 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Smarcc2Q6PDG5 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Smarcc2Q6PDG5 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Smarcc2Q6PDG5 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Smarcc2Q6PDG5 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Smarcc2Q6PDG5 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Smarcc2Q6PDG5 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Smarcc2Q6PDG5 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Smarcc2Q6PDG5 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Smarcc2Q6PDG5 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Smarcc2Q6PDG5 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Smarcc2Q6PDG5 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Smarcc2Q6PDG5 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Smarcc2Q6PDG5 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Smarcc2Q6PDG5 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Smarcc2Q6PDG5 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Smarcc2Q6PDG5 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Smarcc2Q6PDG5 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Smarcc2Q6PDG5 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Smarcc2Q6PDG5 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Smarcc2Q6PDG5 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Smarcc2Q6PDG5 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Smarcc2Q6PDG5 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Smarcc2Q6PDG5 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Smarcc2Q6PDG5 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Smarcc2Q6PDG5 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Smarcc2Q6PDG5 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Smarcc2Q6PDG5 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Smarcc2Q6PDG5 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Smarcc2Q6PDG5 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Smarcc2Q6PDG5 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Smarcc2Q6PDG5 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Smarcc2Q6PDG5 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Smarcc2Q6PDG5 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Smarcc2Q6PDG5 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Smarcc2Q6PDG5 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Smarcc2Q6PDG5 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Smarcc2Q6PDG5 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Smarcc2Q6PDG5 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Smarcc2Q6PDG5 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Smarcc2Q6PDG5 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Smarcc2Q6PDG5 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Smarcc2Q6PDG5 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Smarcc2Q6PDG5 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Smarcc2Q6PDG5 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Smarcc2Q6PDG5 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Smarcc2Q6PDG5 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Smarcc2Q6PDG5 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Smarcc2Q6PDG5 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Smarcc2Q6PDG5 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Smarcc2Q6PDG5 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Smarcc2Q6PDG5 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Smarcc2Q6PDG5 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Smarcc2Q6PDG5 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Smarcc2Q6PDG5 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Smarcc2Q6PDG5 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Smarcc2Q6PDG5 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Smarcc2Q6PDG5 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Smarcc2Q6PDG5 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Smarcc2Q6PDG5 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Smarcc2Q6PDG5 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Smarcc2Q6PDG5 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Smarcc2Q6PDG5 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Smarcc2Q6PDG5 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Smarcc2Q6PDG5 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Smarcc2Q6PDG5 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Smarcc2Q6PDG5 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Smarcc2Q6PDG5 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Smarcc2Q6PDG5 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Smarcc2Q6PDG5 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Smarcc2Q6PDG5 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Smarcc2Q6PDG5 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Smarcc2Q6PDG5 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Smarcc2Q6PDG5 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Smarcc2Q6PDG5 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Smarcc2Q6PDG5 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Smarcc2Q6PDG5 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Smarcc2Q6PDG5 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Smarcc2Q6PDG5 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Smarcc2Q6PDG5 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Smarcc2Q6PDG5 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Smarcc2Q6PDG5 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Smarcc2Q6PDG5 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Smarcc2Q6PDG5 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Smarcc2Q6PDG5 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Smarcc2Q6PDG5 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Smarcc2Q6PDG5 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Smarcc2Q6PDG5 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Smarcc2Q6PDG5 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Smarcc2Q6PDG5 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Smarcc2Q6PDG5 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Smarcc2Q6PDG5 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Smarcc2Q6PDG5 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Smarcc2Q6PDG5 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Smarcc2Q6PDG5 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Smarcc2Q6PDG5 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Smarcc2Q6PDG5 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Smarcc2Q6PDG5 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms