Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDC0

Rundc3b, RUN domain-containing protein 3B, mousemouse

Predictions only

Length 408 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rundc3bQ6PDC0 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rundc3bQ6PDC0 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rundc3bQ6PDC0 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rundc3bQ6PDC0 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rundc3bQ6PDC0 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rundc3bQ6PDC0 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rundc3bQ6PDC0 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rundc3bQ6PDC0 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rundc3bQ6PDC0 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rundc3bQ6PDC0 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rundc3bQ6PDC0 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rundc3bQ6PDC0 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rundc3bQ6PDC0 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rundc3bQ6PDC0 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rundc3bQ6PDC0 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rundc3bQ6PDC0 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rundc3bQ6PDC0 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Rundc3bQ6PDC0 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rundc3bQ6PDC0 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rundc3bQ6PDC0 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rundc3bQ6PDC0 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rundc3bQ6PDC0 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rundc3bQ6PDC0 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rundc3bQ6PDC0 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rundc3bQ6PDC0 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rundc3bQ6PDC0 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rundc3bQ6PDC0 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rundc3bQ6PDC0 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rundc3bQ6PDC0 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rundc3bQ6PDC0 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rundc3bQ6PDC0 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rundc3bQ6PDC0 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rundc3bQ6PDC0 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rundc3bQ6PDC0 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rundc3bQ6PDC0 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rundc3bQ6PDC0 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rundc3bQ6PDC0 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rundc3bQ6PDC0 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rundc3bQ6PDC0 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rundc3bQ6PDC0 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rundc3bQ6PDC0 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rundc3bQ6PDC0 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rundc3bQ6PDC0 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rundc3bQ6PDC0 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rundc3bQ6PDC0 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rundc3bQ6PDC0 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rundc3bQ6PDC0 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rundc3bQ6PDC0 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rundc3bQ6PDC0 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rundc3bQ6PDC0 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rundc3bQ6PDC0 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rundc3bQ6PDC0 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rundc3bQ6PDC0 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rundc3bQ6PDC0 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rundc3bQ6PDC0 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rundc3bQ6PDC0 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rundc3bQ6PDC0 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rundc3bQ6PDC0 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rundc3bQ6PDC0 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Rundc3bQ6PDC0 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Rundc3bQ6PDC0 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Rundc3bQ6PDC0 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rundc3bQ6PDC0 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rundc3bQ6PDC0 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rundc3bQ6PDC0 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rundc3bQ6PDC0 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rundc3bQ6PDC0 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Rundc3bQ6PDC0 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rundc3bQ6PDC0 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rundc3bQ6PDC0 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rundc3bQ6PDC0 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rundc3bQ6PDC0 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rundc3bQ6PDC0 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rundc3bQ6PDC0 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rundc3bQ6PDC0 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rundc3bQ6PDC0 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rundc3bQ6PDC0 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rundc3bQ6PDC0 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rundc3bQ6PDC0 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rundc3bQ6PDC0 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rundc3bQ6PDC0 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rundc3bQ6PDC0 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rundc3bQ6PDC0 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rundc3bQ6PDC0 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rundc3bQ6PDC0 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rundc3bQ6PDC0 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rundc3bQ6PDC0 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rundc3bQ6PDC0 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rundc3bQ6PDC0 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rundc3bQ6PDC0 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rundc3bQ6PDC0 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rundc3bQ6PDC0 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rundc3bQ6PDC0 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rundc3bQ6PDC0 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rundc3bQ6PDC0 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rundc3bQ6PDC0 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rundc3bQ6PDC0 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rundc3bQ6PDC0 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Rundc3bQ6PDC0 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rundc3bQ6PDC0 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms