Protein–RNA interactions for Protein: Q6PD19

UPF0668 protein C10orf76 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 689 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q6PD19 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Q6PD19 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Q6PD19 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Q6PD19 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Q6PD19 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Q6PD19 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Q6PD19 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Q6PD19 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Q6PD19 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Q6PD19 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Q6PD19 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Q6PD19 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
Q6PD19 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Q6PD19 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Q6PD19 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Q6PD19 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Q6PD19 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Q6PD19 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Q6PD19 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Q6PD19 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
Q6PD19 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Q6PD19 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Q6PD19 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Q6PD19 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
Q6PD19 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Q6PD19 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Q6PD19 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Q6PD19 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Q6PD19 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Q6PD19 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Q6PD19 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Q6PD19 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Q6PD19 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Q6PD19 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Q6PD19 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Q6PD19 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Q6PD19 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Q6PD19 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Q6PD19 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Q6PD19 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Q6PD19 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Q6PD19 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Q6PD19 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Q6PD19 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
Q6PD19 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Q6PD19 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Q6PD19 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Q6PD19 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Q6PD19 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
Q6PD19 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Q6PD19 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Q6PD19 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Q6PD19 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Q6PD19 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Q6PD19 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Q6PD19 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Q6PD19 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Q6PD19 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Q6PD19 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Q6PD19 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
Q6PD19 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Q6PD19 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Q6PD19 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Q6PD19 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
Q6PD19 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Q6PD19 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Q6PD19 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Q6PD19 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
Q6PD19 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Q6PD19 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Q6PD19 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Q6PD19 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Q6PD19 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Q6PD19 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Q6PD19 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Q6PD19 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Q6PD19 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Q6PD19 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Q6PD19 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Q6PD19 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Q6PD19 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Q6PD19 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Q6PD19 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Q6PD19 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Q6PD19 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Q6PD19 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Q6PD19 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Q6PD19 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Q6PD19 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Q6PD19 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Q6PD19 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Q6PD19 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Q6PD19 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Q6PD19 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Q6PD19 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Q6PD19 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Q6PD19 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Q6PD19 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Q6PD19 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Q6PD19 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms