Protein–RNA interactions for Protein: Q6PB51

Ccdc117, Coiled-coil domain-containing protein 117, mousemouse

Predictions only

Length 277 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc117Q6PB51 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc117Q6PB51 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc117Q6PB51 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc117Q6PB51 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc117Q6PB51 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc117Q6PB51 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc117Q6PB51 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc117Q6PB51 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc117Q6PB51 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc117Q6PB51 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc117Q6PB51 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc117Q6PB51 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Ccdc117Q6PB51 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc117Q6PB51 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc117Q6PB51 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc117Q6PB51 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc117Q6PB51 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc117Q6PB51 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc117Q6PB51 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc117Q6PB51 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc117Q6PB51 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc117Q6PB51 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc117Q6PB51 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc117Q6PB51 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc117Q6PB51 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc117Q6PB51 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc117Q6PB51 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc117Q6PB51 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc117Q6PB51 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc117Q6PB51 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc117Q6PB51 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc117Q6PB51 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc117Q6PB51 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc117Q6PB51 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc117Q6PB51 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc117Q6PB51 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc117Q6PB51 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc117Q6PB51 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc117Q6PB51 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc117Q6PB51 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc117Q6PB51 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc117Q6PB51 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc117Q6PB51 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc117Q6PB51 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc117Q6PB51 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc117Q6PB51 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc117Q6PB51 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc117Q6PB51 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc117Q6PB51 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc117Q6PB51 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc117Q6PB51 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc117Q6PB51 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc117Q6PB51 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc117Q6PB51 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc117Q6PB51 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc117Q6PB51 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc117Q6PB51 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc117Q6PB51 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc117Q6PB51 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc117Q6PB51 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc117Q6PB51 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc117Q6PB51 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc117Q6PB51 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc117Q6PB51 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc117Q6PB51 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc117Q6PB51 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc117Q6PB51 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc117Q6PB51 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc117Q6PB51 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc117Q6PB51 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc117Q6PB51 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc117Q6PB51 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc117Q6PB51 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc117Q6PB51 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc117Q6PB51 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc117Q6PB51 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc117Q6PB51 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc117Q6PB51 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc117Q6PB51 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc117Q6PB51 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc117Q6PB51 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc117Q6PB51 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ccdc117Q6PB51 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Ccdc117Q6PB51 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ccdc117Q6PB51 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ccdc117Q6PB51 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ccdc117Q6PB51 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ccdc117Q6PB51 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ccdc117Q6PB51 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ccdc117Q6PB51 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ccdc117Q6PB51 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ccdc117Q6PB51 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ccdc117Q6PB51 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ccdc117Q6PB51 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ccdc117Q6PB51 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ccdc117Q6PB51 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ccdc117Q6PB51 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ccdc117Q6PB51 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc117Q6PB51 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc117Q6PB51 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.7 ms