Protein–RNA interactions for Protein: Q6PAM0

Prkab2, 5'-AMP-activated protein kinase subunit beta-2, mousemouse

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prkab2Q6PAM0 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Prkab2Q6PAM0 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Prkab2Q6PAM0 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Prkab2Q6PAM0 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Prkab2Q6PAM0 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Prkab2Q6PAM0 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Prkab2Q6PAM0 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Prkab2Q6PAM0 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Prkab2Q6PAM0 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Prkab2Q6PAM0 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Prkab2Q6PAM0 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Prkab2Q6PAM0 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Prkab2Q6PAM0 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Prkab2Q6PAM0 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Prkab2Q6PAM0 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Prkab2Q6PAM0 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Prkab2Q6PAM0 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Prkab2Q6PAM0 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Prkab2Q6PAM0 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Prkab2Q6PAM0 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Prkab2Q6PAM0 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Prkab2Q6PAM0 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Prkab2Q6PAM0 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Prkab2Q6PAM0 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Prkab2Q6PAM0 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Prkab2Q6PAM0 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Prkab2Q6PAM0 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Prkab2Q6PAM0 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Prkab2Q6PAM0 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Prkab2Q6PAM0 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Prkab2Q6PAM0 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Prkab2Q6PAM0 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Prkab2Q6PAM0 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Prkab2Q6PAM0 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Prkab2Q6PAM0 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Prkab2Q6PAM0 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Prkab2Q6PAM0 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Prkab2Q6PAM0 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Prkab2Q6PAM0 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Prkab2Q6PAM0 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Prkab2Q6PAM0 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Prkab2Q6PAM0 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Prkab2Q6PAM0 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Prkab2Q6PAM0 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Prkab2Q6PAM0 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Prkab2Q6PAM0 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Prkab2Q6PAM0 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Prkab2Q6PAM0 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Prkab2Q6PAM0 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Prkab2Q6PAM0 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Prkab2Q6PAM0 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Prkab2Q6PAM0 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Prkab2Q6PAM0 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Prkab2Q6PAM0 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Prkab2Q6PAM0 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Prkab2Q6PAM0 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Prkab2Q6PAM0 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Prkab2Q6PAM0 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Prkab2Q6PAM0 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Prkab2Q6PAM0 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Prkab2Q6PAM0 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Prkab2Q6PAM0 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Prkab2Q6PAM0 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Prkab2Q6PAM0 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Prkab2Q6PAM0 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Prkab2Q6PAM0 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Prkab2Q6PAM0 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Prkab2Q6PAM0 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Prkab2Q6PAM0 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Prkab2Q6PAM0 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Prkab2Q6PAM0 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Prkab2Q6PAM0 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Prkab2Q6PAM0 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Prkab2Q6PAM0 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Prkab2Q6PAM0 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Prkab2Q6PAM0 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Prkab2Q6PAM0 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Prkab2Q6PAM0 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Prkab2Q6PAM0 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Prkab2Q6PAM0 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Prkab2Q6PAM0 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Prkab2Q6PAM0 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Prkab2Q6PAM0 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Prkab2Q6PAM0 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Prkab2Q6PAM0 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Prkab2Q6PAM0 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Prkab2Q6PAM0 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Prkab2Q6PAM0 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Prkab2Q6PAM0 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Prkab2Q6PAM0 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Prkab2Q6PAM0 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Prkab2Q6PAM0 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Prkab2Q6PAM0 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Prkab2Q6PAM0 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Prkab2Q6PAM0 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Prkab2Q6PAM0 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Prkab2Q6PAM0 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Prkab2Q6PAM0 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Prkab2Q6PAM0 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Prkab2Q6PAM0 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms