Protein–RNA interactions for Protein: Q6P9L4

Usp49, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 49, mousemouse

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Length 685 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp49Q6P9L4 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Usp49Q6P9L4 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Usp49Q6P9L4 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Usp49Q6P9L4 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Usp49Q6P9L4 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Usp49Q6P9L4 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Usp49Q6P9L4 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Usp49Q6P9L4 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Usp49Q6P9L4 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Usp49Q6P9L4 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Usp49Q6P9L4 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Usp49Q6P9L4 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Usp49Q6P9L4 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC21.83■■□□□ 1.08
Usp49Q6P9L4 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Usp49Q6P9L4 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Usp49Q6P9L4 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Usp49Q6P9L4 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Usp49Q6P9L4 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Usp49Q6P9L4 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Usp49Q6P9L4 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Usp49Q6P9L4 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Usp49Q6P9L4 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Usp49Q6P9L4 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Usp49Q6P9L4 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Usp49Q6P9L4 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Usp49Q6P9L4 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Usp49Q6P9L4 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Usp49Q6P9L4 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Usp49Q6P9L4 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Usp49Q6P9L4 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Usp49Q6P9L4 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Usp49Q6P9L4 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Usp49Q6P9L4 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Usp49Q6P9L4 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Usp49Q6P9L4 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Usp49Q6P9L4 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Usp49Q6P9L4 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Usp49Q6P9L4 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Usp49Q6P9L4 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Usp49Q6P9L4 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Usp49Q6P9L4 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Usp49Q6P9L4 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Usp49Q6P9L4 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Usp49Q6P9L4 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Usp49Q6P9L4 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Usp49Q6P9L4 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Usp49Q6P9L4 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Usp49Q6P9L4 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Usp49Q6P9L4 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Usp49Q6P9L4 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Usp49Q6P9L4 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Usp49Q6P9L4 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Usp49Q6P9L4 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Usp49Q6P9L4 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Usp49Q6P9L4 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Usp49Q6P9L4 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Usp49Q6P9L4 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Usp49Q6P9L4 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Usp49Q6P9L4 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Usp49Q6P9L4 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Usp49Q6P9L4 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Usp49Q6P9L4 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Usp49Q6P9L4 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Usp49Q6P9L4 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Usp49Q6P9L4 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Usp49Q6P9L4 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Usp49Q6P9L4 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Usp49Q6P9L4 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Usp49Q6P9L4 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Usp49Q6P9L4 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Usp49Q6P9L4 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Usp49Q6P9L4 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Usp49Q6P9L4 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Usp49Q6P9L4 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Usp49Q6P9L4 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Usp49Q6P9L4 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Usp49Q6P9L4 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Usp49Q6P9L4 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Usp49Q6P9L4 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Usp49Q6P9L4 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Usp49Q6P9L4 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Usp49Q6P9L4 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Usp49Q6P9L4 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Usp49Q6P9L4 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Usp49Q6P9L4 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Usp49Q6P9L4 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Usp49Q6P9L4 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Usp49Q6P9L4 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Usp49Q6P9L4 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Usp49Q6P9L4 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Usp49Q6P9L4 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Usp49Q6P9L4 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Usp49Q6P9L4 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Usp49Q6P9L4 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Usp49Q6P9L4 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Usp49Q6P9L4 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Usp49Q6P9L4 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Usp49Q6P9L4 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Usp49Q6P9L4 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Usp49Q6P9L4 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
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