Protein–RNA interactions for Protein: Q6P5C5

Smug1, Single-strand selective monofunctional uracil DNA glycosylase, mousemouse

Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smug1Q6P5C5 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Smug1Q6P5C5 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Smug1Q6P5C5 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Smug1Q6P5C5 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Smug1Q6P5C5 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Smug1Q6P5C5 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Smug1Q6P5C5 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Smug1Q6P5C5 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Smug1Q6P5C5 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Smug1Q6P5C5 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Smug1Q6P5C5 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Smug1Q6P5C5 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smug1Q6P5C5 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smug1Q6P5C5 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smug1Q6P5C5 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smug1Q6P5C5 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smug1Q6P5C5 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smug1Q6P5C5 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smug1Q6P5C5 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smug1Q6P5C5 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smug1Q6P5C5 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smug1Q6P5C5 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smug1Q6P5C5 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smug1Q6P5C5 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smug1Q6P5C5 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Smug1Q6P5C5 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smug1Q6P5C5 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smug1Q6P5C5 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smug1Q6P5C5 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smug1Q6P5C5 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smug1Q6P5C5 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smug1Q6P5C5 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smug1Q6P5C5 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smug1Q6P5C5 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Smug1Q6P5C5 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Smug1Q6P5C5 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Smug1Q6P5C5 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smug1Q6P5C5 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smug1Q6P5C5 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smug1Q6P5C5 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smug1Q6P5C5 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smug1Q6P5C5 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smug1Q6P5C5 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smug1Q6P5C5 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smug1Q6P5C5 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smug1Q6P5C5 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Smug1Q6P5C5 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smug1Q6P5C5 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smug1Q6P5C5 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smug1Q6P5C5 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smug1Q6P5C5 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smug1Q6P5C5 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smug1Q6P5C5 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Smug1Q6P5C5 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Smug1Q6P5C5 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Smug1Q6P5C5 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Smug1Q6P5C5 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Smug1Q6P5C5 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Smug1Q6P5C5 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Smug1Q6P5C5 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Smug1Q6P5C5 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Smug1Q6P5C5 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Smug1Q6P5C5 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Smug1Q6P5C5 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Smug1Q6P5C5 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Smug1Q6P5C5 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Smug1Q6P5C5 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Smug1Q6P5C5 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smug1Q6P5C5 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smug1Q6P5C5 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smug1Q6P5C5 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smug1Q6P5C5 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Smug1Q6P5C5 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smug1Q6P5C5 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Smug1Q6P5C5 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smug1Q6P5C5 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smug1Q6P5C5 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smug1Q6P5C5 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smug1Q6P5C5 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Smug1Q6P5C5 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Smug1Q6P5C5 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Smug1Q6P5C5 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Smug1Q6P5C5 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Smug1Q6P5C5 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Smug1Q6P5C5 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Smug1Q6P5C5 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Smug1Q6P5C5 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Smug1Q6P5C5 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Smug1Q6P5C5 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Smug1Q6P5C5 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Smug1Q6P5C5 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Smug1Q6P5C5 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Smug1Q6P5C5 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Smug1Q6P5C5 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Smug1Q6P5C5 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Smug1Q6P5C5 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Smug1Q6P5C5 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Smug1Q6P5C5 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Smug1Q6P5C5 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Smug1Q6P5C5 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.8 ms