Protein–RNA interactions for Protein: Q6P3A4

Vsig8, V-set and immunoglobulin domain-containing protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vsig8Q6P3A4 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vsig8Q6P3A4 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vsig8Q6P3A4 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vsig8Q6P3A4 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vsig8Q6P3A4 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vsig8Q6P3A4 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Vsig8Q6P3A4 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vsig8Q6P3A4 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vsig8Q6P3A4 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vsig8Q6P3A4 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vsig8Q6P3A4 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vsig8Q6P3A4 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vsig8Q6P3A4 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vsig8Q6P3A4 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vsig8Q6P3A4 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vsig8Q6P3A4 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vsig8Q6P3A4 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vsig8Q6P3A4 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vsig8Q6P3A4 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vsig8Q6P3A4 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vsig8Q6P3A4 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vsig8Q6P3A4 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vsig8Q6P3A4 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vsig8Q6P3A4 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vsig8Q6P3A4 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vsig8Q6P3A4 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vsig8Q6P3A4 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Vsig8Q6P3A4 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vsig8Q6P3A4 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vsig8Q6P3A4 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vsig8Q6P3A4 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vsig8Q6P3A4 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vsig8Q6P3A4 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vsig8Q6P3A4 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vsig8Q6P3A4 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Vsig8Q6P3A4 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vsig8Q6P3A4 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vsig8Q6P3A4 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vsig8Q6P3A4 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vsig8Q6P3A4 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vsig8Q6P3A4 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vsig8Q6P3A4 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vsig8Q6P3A4 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vsig8Q6P3A4 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vsig8Q6P3A4 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vsig8Q6P3A4 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vsig8Q6P3A4 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vsig8Q6P3A4 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vsig8Q6P3A4 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vsig8Q6P3A4 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Vsig8Q6P3A4 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vsig8Q6P3A4 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vsig8Q6P3A4 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vsig8Q6P3A4 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vsig8Q6P3A4 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vsig8Q6P3A4 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vsig8Q6P3A4 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vsig8Q6P3A4 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vsig8Q6P3A4 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vsig8Q6P3A4 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vsig8Q6P3A4 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vsig8Q6P3A4 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vsig8Q6P3A4 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vsig8Q6P3A4 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vsig8Q6P3A4 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vsig8Q6P3A4 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vsig8Q6P3A4 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vsig8Q6P3A4 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vsig8Q6P3A4 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vsig8Q6P3A4 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vsig8Q6P3A4 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vsig8Q6P3A4 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vsig8Q6P3A4 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vsig8Q6P3A4 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vsig8Q6P3A4 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vsig8Q6P3A4 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vsig8Q6P3A4 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vsig8Q6P3A4 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vsig8Q6P3A4 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vsig8Q6P3A4 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vsig8Q6P3A4 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vsig8Q6P3A4 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vsig8Q6P3A4 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vsig8Q6P3A4 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vsig8Q6P3A4 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vsig8Q6P3A4 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vsig8Q6P3A4 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Vsig8Q6P3A4 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Vsig8Q6P3A4 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Vsig8Q6P3A4 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Vsig8Q6P3A4 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vsig8Q6P3A4 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vsig8Q6P3A4 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vsig8Q6P3A4 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vsig8Q6P3A4 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vsig8Q6P3A4 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vsig8Q6P3A4 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vsig8Q6P3A4 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vsig8Q6P3A4 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vsig8Q6P3A4 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 94.5 ms