Protein–RNA interactions for Protein: Q6P1D7

Slx4, Structure-specific endonuclease subunit SLX4, mousemouse

Predictions only

Length 1,565 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slx4Q6P1D7 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC30.55■■■□□ 2.48
Slx4Q6P1D7 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
Slx4Q6P1D7 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
Slx4Q6P1D7 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
Slx4Q6P1D7 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.54■■■□□ 2.48
Slx4Q6P1D7 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
Slx4Q6P1D7 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
Slx4Q6P1D7 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
Slx4Q6P1D7 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC30.54■■■□□ 2.48
Slx4Q6P1D7 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
Slx4Q6P1D7 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
Slx4Q6P1D7 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
Slx4Q6P1D7 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.53■■■□□ 2.48
Slx4Q6P1D7 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
Slx4Q6P1D7 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
Slx4Q6P1D7 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
Slx4Q6P1D7 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC30.53■■■□□ 2.48
Slx4Q6P1D7 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
Slx4Q6P1D7 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
Slx4Q6P1D7 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
Slx4Q6P1D7 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC30.52■■■□□ 2.48
Slx4Q6P1D7 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
Slx4Q6P1D7 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.48
Slx4Q6P1D7 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.48
Slx4Q6P1D7 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.51■■■□□ 2.47
Slx4Q6P1D7 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
Slx4Q6P1D7 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.51■■■□□ 2.47
Slx4Q6P1D7 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.51■■■□□ 2.47
Slx4Q6P1D7 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC30.51■■■□□ 2.47
Slx4Q6P1D7 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.51■■■□□ 2.47
Slx4Q6P1D7 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
Slx4Q6P1D7 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.51■■■□□ 2.47
Slx4Q6P1D7 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
Slx4Q6P1D7 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
Slx4Q6P1D7 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
Slx4Q6P1D7 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC30.5■■■□□ 2.47
Slx4Q6P1D7 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
Slx4Q6P1D7 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
Slx4Q6P1D7 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC30.49■■■□□ 2.47
Slx4Q6P1D7 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC30.49■■■□□ 2.47
Slx4Q6P1D7 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
Slx4Q6P1D7 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
Slx4Q6P1D7 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
Slx4Q6P1D7 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
Slx4Q6P1D7 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
Slx4Q6P1D7 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC30.48■■■□□ 2.47
Slx4Q6P1D7 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
Slx4Q6P1D7 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
Slx4Q6P1D7 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
Slx4Q6P1D7 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
Slx4Q6P1D7 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
Slx4Q6P1D7 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
Slx4Q6P1D7 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
Slx4Q6P1D7 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
Slx4Q6P1D7 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
Slx4Q6P1D7 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
Slx4Q6P1D7 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
Slx4Q6P1D7 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC30.46■■■□□ 2.47
Slx4Q6P1D7 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
Slx4Q6P1D7 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
Slx4Q6P1D7 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC30.45■■■□□ 2.47
Slx4Q6P1D7 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC30.45■■■□□ 2.47
Slx4Q6P1D7 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
Slx4Q6P1D7 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.46
Slx4Q6P1D7 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.46
Slx4Q6P1D7 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC30.45■■■□□ 2.46
Slx4Q6P1D7 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.46
Slx4Q6P1D7 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
Slx4Q6P1D7 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC30.44■■■□□ 2.46
Slx4Q6P1D7 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
Slx4Q6P1D7 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC30.44■■■□□ 2.46
Slx4Q6P1D7 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
Slx4Q6P1D7 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC30.43■■■□□ 2.46
Slx4Q6P1D7 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
Slx4Q6P1D7 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
Slx4Q6P1D7 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC30.42■■■□□ 2.46
Slx4Q6P1D7 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.42■■■□□ 2.46
Slx4Q6P1D7 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
Slx4Q6P1D7 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
Slx4Q6P1D7 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
Slx4Q6P1D7 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
Slx4Q6P1D7 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
Slx4Q6P1D7 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
Slx4Q6P1D7 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
Slx4Q6P1D7 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
Slx4Q6P1D7 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
Slx4Q6P1D7 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC30.4■■■□□ 2.46
Slx4Q6P1D7 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC30.4■■■□□ 2.46
Slx4Q6P1D7 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.4■■■□□ 2.46
Slx4Q6P1D7 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
Slx4Q6P1D7 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
Slx4Q6P1D7 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
Slx4Q6P1D7 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC30.4■■■□□ 2.46
Slx4Q6P1D7 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
Slx4Q6P1D7 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.4■■■□□ 2.46
Slx4Q6P1D7 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
Slx4Q6P1D7 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC30.4■■■□□ 2.46
Slx4Q6P1D7 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
Slx4Q6P1D7 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
Slx4Q6P1D7 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms