Protein–RNA interactions for Protein: Q6NZN1

Pprc1, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma coactivator-related protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,644 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pprc1Q6NZN1 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC30.18■■■□□ 2.42
Pprc1Q6NZN1 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
Pprc1Q6NZN1 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
Pprc1Q6NZN1 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
Pprc1Q6NZN1 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
Pprc1Q6NZN1 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.16■■■□□ 2.42
Pprc1Q6NZN1 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
Pprc1Q6NZN1 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC30.16■■■□□ 2.42
Pprc1Q6NZN1 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC30.16■■■□□ 2.42
Pprc1Q6NZN1 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC30.16■■■□□ 2.42
Pprc1Q6NZN1 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
Pprc1Q6NZN1 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
Pprc1Q6NZN1 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC30.15■■■□□ 2.42
Pprc1Q6NZN1 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
Pprc1Q6NZN1 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.15■■■□□ 2.42
Pprc1Q6NZN1 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
Pprc1Q6NZN1 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
Pprc1Q6NZN1 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
Pprc1Q6NZN1 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
Pprc1Q6NZN1 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC30.14■■■□□ 2.42
Pprc1Q6NZN1 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
Pprc1Q6NZN1 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC30.14■■■□□ 2.42
Pprc1Q6NZN1 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
Pprc1Q6NZN1 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
Pprc1Q6NZN1 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.41
Pprc1Q6NZN1 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.41
Pprc1Q6NZN1 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.14■■■□□ 2.41
Pprc1Q6NZN1 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.13■■■□□ 2.41
Pprc1Q6NZN1 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
Pprc1Q6NZN1 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
Pprc1Q6NZN1 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC30.13■■■□□ 2.41
Pprc1Q6NZN1 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
Pprc1Q6NZN1 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
Pprc1Q6NZN1 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
Pprc1Q6NZN1 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
Pprc1Q6NZN1 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC30.12■■■□□ 2.41
Pprc1Q6NZN1 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
Pprc1Q6NZN1 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
Pprc1Q6NZN1 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC30.12■■■□□ 2.41
Pprc1Q6NZN1 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
Pprc1Q6NZN1 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC30.11■■■□□ 2.41
Pprc1Q6NZN1 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
Pprc1Q6NZN1 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
Pprc1Q6NZN1 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
Pprc1Q6NZN1 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC30.11■■■□□ 2.41
Pprc1Q6NZN1 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC30.11■■■□□ 2.41
Pprc1Q6NZN1 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
Pprc1Q6NZN1 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC30.11■■■□□ 2.41
Pprc1Q6NZN1 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
Pprc1Q6NZN1 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC30.1■■■□□ 2.41
Pprc1Q6NZN1 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
Pprc1Q6NZN1 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC30.1■■■□□ 2.41
Pprc1Q6NZN1 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC30.1■■■□□ 2.41
Pprc1Q6NZN1 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.1■■■□□ 2.41
Pprc1Q6NZN1 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.09■■■□□ 2.41
Pprc1Q6NZN1 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC30.09■■■□□ 2.41
Pprc1Q6NZN1 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC30.09■■■□□ 2.41
Pprc1Q6NZN1 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
Pprc1Q6NZN1 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
Pprc1Q6NZN1 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
Pprc1Q6NZN1 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
Pprc1Q6NZN1 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
Pprc1Q6NZN1 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
Pprc1Q6NZN1 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
Pprc1Q6NZN1 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
Pprc1Q6NZN1 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
Pprc1Q6NZN1 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
Pprc1Q6NZN1 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
Pprc1Q6NZN1 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
Pprc1Q6NZN1 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
Pprc1Q6NZN1 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
Pprc1Q6NZN1 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
Pprc1Q6NZN1 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
Pprc1Q6NZN1 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
Pprc1Q6NZN1 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
Pprc1Q6NZN1 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
Pprc1Q6NZN1 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
Pprc1Q6NZN1 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
Pprc1Q6NZN1 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Pprc1Q6NZN1 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Pprc1Q6NZN1 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.06■■■□□ 2.4
Pprc1Q6NZN1 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Pprc1Q6NZN1 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Pprc1Q6NZN1 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Pprc1Q6NZN1 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
Pprc1Q6NZN1 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
Pprc1Q6NZN1 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC30.05■■■□□ 2.4
Pprc1Q6NZN1 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC30.05■■■□□ 2.4
Pprc1Q6NZN1 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
Pprc1Q6NZN1 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
Pprc1Q6NZN1 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
Pprc1Q6NZN1 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
Pprc1Q6NZN1 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
Pprc1Q6NZN1 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
Pprc1Q6NZN1 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
Pprc1Q6NZN1 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Pprc1Q6NZN1 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC30.03■■■□□ 2.4
Pprc1Q6NZN1 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC30.03■■■□□ 2.4
Pprc1Q6NZN1 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.03■■■□□ 2.4
Pprc1Q6NZN1 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC30.03■■■□□ 2.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms