Protein–RNA interactions for Protein: Q6NV83

U2surp, U2 snRNP-associated SURP motif-containing protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,029 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U2surpQ6NV83 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
U2surpQ6NV83 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
U2surpQ6NV83 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
U2surpQ6NV83 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
U2surpQ6NV83 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
U2surpQ6NV83 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
U2surpQ6NV83 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
U2surpQ6NV83 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
U2surpQ6NV83 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
U2surpQ6NV83 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
U2surpQ6NV83 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
U2surpQ6NV83 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
U2surpQ6NV83 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
U2surpQ6NV83 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
U2surpQ6NV83 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
U2surpQ6NV83 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
U2surpQ6NV83 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
U2surpQ6NV83 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
U2surpQ6NV83 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
U2surpQ6NV83 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
U2surpQ6NV83 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
U2surpQ6NV83 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
U2surpQ6NV83 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
U2surpQ6NV83 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
U2surpQ6NV83 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
U2surpQ6NV83 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
U2surpQ6NV83 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
U2surpQ6NV83 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
U2surpQ6NV83 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
U2surpQ6NV83 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
U2surpQ6NV83 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
U2surpQ6NV83 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
U2surpQ6NV83 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
U2surpQ6NV83 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
U2surpQ6NV83 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
U2surpQ6NV83 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
U2surpQ6NV83 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
U2surpQ6NV83 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
U2surpQ6NV83 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
U2surpQ6NV83 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
U2surpQ6NV83 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
U2surpQ6NV83 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
U2surpQ6NV83 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
U2surpQ6NV83 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
U2surpQ6NV83 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
U2surpQ6NV83 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
U2surpQ6NV83 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
U2surpQ6NV83 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
U2surpQ6NV83 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
U2surpQ6NV83 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
U2surpQ6NV83 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
U2surpQ6NV83 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
U2surpQ6NV83 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
U2surpQ6NV83 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
U2surpQ6NV83 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
U2surpQ6NV83 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
U2surpQ6NV83 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
U2surpQ6NV83 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
U2surpQ6NV83 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
U2surpQ6NV83 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
U2surpQ6NV83 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
U2surpQ6NV83 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
U2surpQ6NV83 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
U2surpQ6NV83 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
U2surpQ6NV83 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
U2surpQ6NV83 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
U2surpQ6NV83 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
U2surpQ6NV83 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
U2surpQ6NV83 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
U2surpQ6NV83 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
U2surpQ6NV83 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
U2surpQ6NV83 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
U2surpQ6NV83 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
U2surpQ6NV83 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
U2surpQ6NV83 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
U2surpQ6NV83 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
U2surpQ6NV83 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
U2surpQ6NV83 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
U2surpQ6NV83 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
U2surpQ6NV83 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
U2surpQ6NV83 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
U2surpQ6NV83 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC25■■□□□ 1.59
U2surpQ6NV83 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
U2surpQ6NV83 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC25■■□□□ 1.59
U2surpQ6NV83 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
U2surpQ6NV83 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC25■■□□□ 1.59
U2surpQ6NV83 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
U2surpQ6NV83 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
U2surpQ6NV83 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
U2surpQ6NV83 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
U2surpQ6NV83 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
U2surpQ6NV83 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
U2surpQ6NV83 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
U2surpQ6NV83 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
U2surpQ6NV83 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
U2surpQ6NV83 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
U2surpQ6NV83 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
U2surpQ6NV83 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
U2surpQ6NV83 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
U2surpQ6NV83 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 86.8 ms