Protein–RNA interactions for Protein: Q6NS60

Fbxo41, F-box only protein 41, mousemouse

Predictions only

Length 873 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fbxo41Q6NS60 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Fbxo41Q6NS60 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Fbxo41Q6NS60 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
Fbxo41Q6NS60 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Fbxo41Q6NS60 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
Fbxo41Q6NS60 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Fbxo41Q6NS60 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Fbxo41Q6NS60 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Fbxo41Q6NS60 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Fbxo41Q6NS60 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Fbxo41Q6NS60 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Fbxo41Q6NS60 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Fbxo41Q6NS60 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Fbxo41Q6NS60 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Fbxo41Q6NS60 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Fbxo41Q6NS60 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Fbxo41Q6NS60 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Fbxo41Q6NS60 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Fbxo41Q6NS60 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Fbxo41Q6NS60 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
Fbxo41Q6NS60 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Fbxo41Q6NS60 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Fbxo41Q6NS60 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Fbxo41Q6NS60 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Fbxo41Q6NS60 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Fbxo41Q6NS60 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Fbxo41Q6NS60 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Fbxo41Q6NS60 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Fbxo41Q6NS60 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Fbxo41Q6NS60 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Fbxo41Q6NS60 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Fbxo41Q6NS60 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
Fbxo41Q6NS60 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Fbxo41Q6NS60 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Fbxo41Q6NS60 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Fbxo41Q6NS60 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Fbxo41Q6NS60 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Fbxo41Q6NS60 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Fbxo41Q6NS60 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Fbxo41Q6NS60 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Fbxo41Q6NS60 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
Fbxo41Q6NS60 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Fbxo41Q6NS60 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Fbxo41Q6NS60 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Fbxo41Q6NS60 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Fbxo41Q6NS60 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Fbxo41Q6NS60 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Fbxo41Q6NS60 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Fbxo41Q6NS60 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Fbxo41Q6NS60 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Fbxo41Q6NS60 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Fbxo41Q6NS60 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Fbxo41Q6NS60 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Fbxo41Q6NS60 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Fbxo41Q6NS60 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Fbxo41Q6NS60 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Fbxo41Q6NS60 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Fbxo41Q6NS60 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Fbxo41Q6NS60 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Fbxo41Q6NS60 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Fbxo41Q6NS60 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Fbxo41Q6NS60 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
Fbxo41Q6NS60 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Fbxo41Q6NS60 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Fbxo41Q6NS60 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
Fbxo41Q6NS60 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Fbxo41Q6NS60 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Fbxo41Q6NS60 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Fbxo41Q6NS60 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
Fbxo41Q6NS60 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Fbxo41Q6NS60 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Fbxo41Q6NS60 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
Fbxo41Q6NS60 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Fbxo41Q6NS60 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
Fbxo41Q6NS60 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
Fbxo41Q6NS60 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
Fbxo41Q6NS60 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Fbxo41Q6NS60 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Fbxo41Q6NS60 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Fbxo41Q6NS60 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Fbxo41Q6NS60 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Fbxo41Q6NS60 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Fbxo41Q6NS60 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Fbxo41Q6NS60 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Fbxo41Q6NS60 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
Fbxo41Q6NS60 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
Fbxo41Q6NS60 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Fbxo41Q6NS60 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Fbxo41Q6NS60 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Fbxo41Q6NS60 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Fbxo41Q6NS60 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Fbxo41Q6NS60 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Fbxo41Q6NS60 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Fbxo41Q6NS60 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Fbxo41Q6NS60 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Fbxo41Q6NS60 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Fbxo41Q6NS60 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Fbxo41Q6NS60 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Fbxo41Q6NS60 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Fbxo41Q6NS60 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms