Protein–RNA interactions for Protein: Q6IE21

Otud6a, OTU domain-containing protein 6A, mousemouse

Predictions only

Length 290 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otud6aQ6IE21 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Otud6aQ6IE21 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Otud6aQ6IE21 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Otud6aQ6IE21 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Otud6aQ6IE21 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Otud6aQ6IE21 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Otud6aQ6IE21 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Otud6aQ6IE21 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Otud6aQ6IE21 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Otud6aQ6IE21 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Otud6aQ6IE21 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Otud6aQ6IE21 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Otud6aQ6IE21 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Otud6aQ6IE21 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Otud6aQ6IE21 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Otud6aQ6IE21 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Otud6aQ6IE21 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Otud6aQ6IE21 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Otud6aQ6IE21 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Otud6aQ6IE21 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Otud6aQ6IE21 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Otud6aQ6IE21 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Otud6aQ6IE21 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Otud6aQ6IE21 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Otud6aQ6IE21 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Otud6aQ6IE21 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Otud6aQ6IE21 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Otud6aQ6IE21 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Otud6aQ6IE21 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Otud6aQ6IE21 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Otud6aQ6IE21 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Otud6aQ6IE21 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Otud6aQ6IE21 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Otud6aQ6IE21 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Otud6aQ6IE21 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Otud6aQ6IE21 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Otud6aQ6IE21 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Otud6aQ6IE21 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Otud6aQ6IE21 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Otud6aQ6IE21 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Otud6aQ6IE21 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Otud6aQ6IE21 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Otud6aQ6IE21 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Otud6aQ6IE21 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Otud6aQ6IE21 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Otud6aQ6IE21 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Otud6aQ6IE21 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Otud6aQ6IE21 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Otud6aQ6IE21 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Otud6aQ6IE21 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Otud6aQ6IE21 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Otud6aQ6IE21 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Otud6aQ6IE21 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Otud6aQ6IE21 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Otud6aQ6IE21 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Otud6aQ6IE21 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Otud6aQ6IE21 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Otud6aQ6IE21 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Otud6aQ6IE21 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Otud6aQ6IE21 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Otud6aQ6IE21 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Otud6aQ6IE21 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Otud6aQ6IE21 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Otud6aQ6IE21 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Otud6aQ6IE21 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Otud6aQ6IE21 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Otud6aQ6IE21 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Otud6aQ6IE21 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Otud6aQ6IE21 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Otud6aQ6IE21 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Otud6aQ6IE21 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Otud6aQ6IE21 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Otud6aQ6IE21 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Otud6aQ6IE21 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Otud6aQ6IE21 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Otud6aQ6IE21 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Otud6aQ6IE21 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Otud6aQ6IE21 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Otud6aQ6IE21 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Otud6aQ6IE21 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Otud6aQ6IE21 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Otud6aQ6IE21 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Otud6aQ6IE21 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Otud6aQ6IE21 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Otud6aQ6IE21 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Otud6aQ6IE21 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Otud6aQ6IE21 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Otud6aQ6IE21 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Otud6aQ6IE21 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Otud6aQ6IE21 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Otud6aQ6IE21 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Otud6aQ6IE21 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Otud6aQ6IE21 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Otud6aQ6IE21 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Otud6aQ6IE21 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Otud6aQ6IE21 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Otud6aQ6IE21 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Otud6aQ6IE21 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Otud6aQ6IE21 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Otud6aQ6IE21 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms