Protein–RNA interactions for Protein: Q6DIC0

Smarca2, Probable global transcription activator SNF2L2, mousemouse

Predictions only

Length 1,577 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarca2Q6DIC0 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
Smarca2Q6DIC0 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.85■■■■□ 3.17
Smarca2Q6DIC0 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
Smarca2Q6DIC0 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
Smarca2Q6DIC0 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.84■■■■□ 3.17
Smarca2Q6DIC0 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC34.84■■■■□ 3.17
Smarca2Q6DIC0 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
Smarca2Q6DIC0 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.84■■■■□ 3.17
Smarca2Q6DIC0 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
Smarca2Q6DIC0 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
Smarca2Q6DIC0 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
Smarca2Q6DIC0 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
Smarca2Q6DIC0 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
Smarca2Q6DIC0 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.17
Smarca2Q6DIC0 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.17
Smarca2Q6DIC0 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC34.82■■■■□ 3.16
Smarca2Q6DIC0 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.16
Smarca2Q6DIC0 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.82■■■■□ 3.16
Smarca2Q6DIC0 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.16
Smarca2Q6DIC0 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.82■■■■□ 3.16
Smarca2Q6DIC0 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
Smarca2Q6DIC0 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC34.81■■■■□ 3.16
Smarca2Q6DIC0 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.81■■■■□ 3.16
Smarca2Q6DIC0 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
Smarca2Q6DIC0 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
Smarca2Q6DIC0 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
Smarca2Q6DIC0 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
Smarca2Q6DIC0 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
Smarca2Q6DIC0 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
Smarca2Q6DIC0 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
Smarca2Q6DIC0 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
Smarca2Q6DIC0 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC34.79■■■■□ 3.16
Smarca2Q6DIC0 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
Smarca2Q6DIC0 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
Smarca2Q6DIC0 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
Smarca2Q6DIC0 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
Smarca2Q6DIC0 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
Smarca2Q6DIC0 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.78■■■■□ 3.16
Smarca2Q6DIC0 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
Smarca2Q6DIC0 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC34.77■■■■□ 3.16
Smarca2Q6DIC0 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
Smarca2Q6DIC0 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC34.76■■■■□ 3.16
Smarca2Q6DIC0 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.16
Smarca2Q6DIC0 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC34.76■■■■□ 3.16
Smarca2Q6DIC0 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC34.76■■■■□ 3.16
Smarca2Q6DIC0 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.16
Smarca2Q6DIC0 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC34.76■■■■□ 3.15
Smarca2Q6DIC0 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.15
Smarca2Q6DIC0 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC34.76■■■■□ 3.15
Smarca2Q6DIC0 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.15
Smarca2Q6DIC0 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
Smarca2Q6DIC0 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC34.75■■■■□ 3.15
Smarca2Q6DIC0 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
Smarca2Q6DIC0 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.75■■■■□ 3.15
Smarca2Q6DIC0 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
Smarca2Q6DIC0 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC34.75■■■■□ 3.15
Smarca2Q6DIC0 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
Smarca2Q6DIC0 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
Smarca2Q6DIC0 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC34.74■■■■□ 3.15
Smarca2Q6DIC0 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
Smarca2Q6DIC0 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
Smarca2Q6DIC0 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC34.74■■■■□ 3.15
Smarca2Q6DIC0 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC34.73■■■■□ 3.15
Smarca2Q6DIC0 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
Smarca2Q6DIC0 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
Smarca2Q6DIC0 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.73■■■■□ 3.15
Smarca2Q6DIC0 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
Smarca2Q6DIC0 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
Smarca2Q6DIC0 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
Smarca2Q6DIC0 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
Smarca2Q6DIC0 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
Smarca2Q6DIC0 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC34.72■■■■□ 3.15
Smarca2Q6DIC0 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
Smarca2Q6DIC0 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
Smarca2Q6DIC0 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
Smarca2Q6DIC0 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC34.71■■■■□ 3.15
Smarca2Q6DIC0 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC34.71■■■■□ 3.15
Smarca2Q6DIC0 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
Smarca2Q6DIC0 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC34.71■■■■□ 3.15
Smarca2Q6DIC0 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
Smarca2Q6DIC0 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.7■■■■□ 3.15
Smarca2Q6DIC0 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
Smarca2Q6DIC0 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
Smarca2Q6DIC0 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
Smarca2Q6DIC0 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
Smarca2Q6DIC0 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.14
Smarca2Q6DIC0 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.14
Smarca2Q6DIC0 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.14
Smarca2Q6DIC0 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.14
Smarca2Q6DIC0 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.14
Smarca2Q6DIC0 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
Smarca2Q6DIC0 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.69■■■■□ 3.14
Smarca2Q6DIC0 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
Smarca2Q6DIC0 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC34.69■■■■□ 3.14
Smarca2Q6DIC0 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
Smarca2Q6DIC0 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.68■■■■□ 3.14
Smarca2Q6DIC0 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.68■■■■□ 3.14
Smarca2Q6DIC0 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
Smarca2Q6DIC0 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.67■■■■□ 3.14
Smarca2Q6DIC0 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC34.67■■■■□ 3.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.6 ms