Protein–RNA interactions for Protein: Q6DFW0

Guanine nucleotide exchange C9orf72 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q6DFW0 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Q6DFW0 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Q6DFW0 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Q6DFW0 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Q6DFW0 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Q6DFW0 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Q6DFW0 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Q6DFW0 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Q6DFW0 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Q6DFW0 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Q6DFW0 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Q6DFW0 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Q6DFW0 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Q6DFW0 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Q6DFW0 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Q6DFW0 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Q6DFW0 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Q6DFW0 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
Q6DFW0 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
Q6DFW0 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
Q6DFW0 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Q6DFW0 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Q6DFW0 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Q6DFW0 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Q6DFW0 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Q6DFW0 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Q6DFW0 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Q6DFW0 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Q6DFW0 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Q6DFW0 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Q6DFW0 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Q6DFW0 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Q6DFW0 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Q6DFW0 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Q6DFW0 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Q6DFW0 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Q6DFW0 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Q6DFW0 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Q6DFW0 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Q6DFW0 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Q6DFW0 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Q6DFW0 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Q6DFW0 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Q6DFW0 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Q6DFW0 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Q6DFW0 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Q6DFW0 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Q6DFW0 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Q6DFW0 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Q6DFW0 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Q6DFW0 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Q6DFW0 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Q6DFW0 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Q6DFW0 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Q6DFW0 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Q6DFW0 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Q6DFW0 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Q6DFW0 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Q6DFW0 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Q6DFW0 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Q6DFW0 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Q6DFW0 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Q6DFW0 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Q6DFW0 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Q6DFW0 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Q6DFW0 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Q6DFW0 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Q6DFW0 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Q6DFW0 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Q6DFW0 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Q6DFW0 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Q6DFW0 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Q6DFW0 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Q6DFW0 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Q6DFW0 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Q6DFW0 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Q6DFW0 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Q6DFW0 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Q6DFW0 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Q6DFW0 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Q6DFW0 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Q6DFW0 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Q6DFW0 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Q6DFW0 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Q6DFW0 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Q6DFW0 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Q6DFW0 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Q6DFW0 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Q6DFW0 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Q6DFW0 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Q6DFW0 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Q6DFW0 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Q6DFW0 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Q6DFW0 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Q6DFW0 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Q6DFW0 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Q6DFW0 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Q6DFW0 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Q6DFW0 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Q6DFW0 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.5 ms