Protein–RNA interactions for Protein: Q6BCL1

Pram1, PML-RARA-regulated adapter molecule 1, mousemouse

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Length 675 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pram1Q6BCL1 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Pram1Q6BCL1 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Pram1Q6BCL1 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Pram1Q6BCL1 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Pram1Q6BCL1 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Pram1Q6BCL1 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Pram1Q6BCL1 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Pram1Q6BCL1 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Pram1Q6BCL1 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Pram1Q6BCL1 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Pram1Q6BCL1 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Pram1Q6BCL1 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Pram1Q6BCL1 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Pram1Q6BCL1 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Pram1Q6BCL1 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Pram1Q6BCL1 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Pram1Q6BCL1 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Pram1Q6BCL1 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Pram1Q6BCL1 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Pram1Q6BCL1 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Pram1Q6BCL1 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Pram1Q6BCL1 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Pram1Q6BCL1 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Pram1Q6BCL1 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Pram1Q6BCL1 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Pram1Q6BCL1 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Pram1Q6BCL1 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Pram1Q6BCL1 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Pram1Q6BCL1 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Pram1Q6BCL1 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Pram1Q6BCL1 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Pram1Q6BCL1 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Pram1Q6BCL1 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Pram1Q6BCL1 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Pram1Q6BCL1 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Pram1Q6BCL1 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Pram1Q6BCL1 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Pram1Q6BCL1 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Pram1Q6BCL1 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Pram1Q6BCL1 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Pram1Q6BCL1 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Pram1Q6BCL1 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Pram1Q6BCL1 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Pram1Q6BCL1 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Pram1Q6BCL1 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Pram1Q6BCL1 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Pram1Q6BCL1 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Pram1Q6BCL1 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Pram1Q6BCL1 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Pram1Q6BCL1 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Pram1Q6BCL1 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Pram1Q6BCL1 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Pram1Q6BCL1 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Pram1Q6BCL1 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Pram1Q6BCL1 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Pram1Q6BCL1 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Pram1Q6BCL1 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Pram1Q6BCL1 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Pram1Q6BCL1 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Pram1Q6BCL1 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Pram1Q6BCL1 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Pram1Q6BCL1 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Pram1Q6BCL1 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Pram1Q6BCL1 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Pram1Q6BCL1 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Pram1Q6BCL1 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Pram1Q6BCL1 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Pram1Q6BCL1 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Pram1Q6BCL1 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Pram1Q6BCL1 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Pram1Q6BCL1 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Pram1Q6BCL1 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Pram1Q6BCL1 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Pram1Q6BCL1 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Pram1Q6BCL1 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Pram1Q6BCL1 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Pram1Q6BCL1 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Pram1Q6BCL1 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Pram1Q6BCL1 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Pram1Q6BCL1 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Pram1Q6BCL1 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Pram1Q6BCL1 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Pram1Q6BCL1 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Pram1Q6BCL1 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Pram1Q6BCL1 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Pram1Q6BCL1 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Pram1Q6BCL1 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Pram1Q6BCL1 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Pram1Q6BCL1 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Pram1Q6BCL1 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Pram1Q6BCL1 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Pram1Q6BCL1 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Pram1Q6BCL1 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Pram1Q6BCL1 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Pram1Q6BCL1 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Pram1Q6BCL1 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Pram1Q6BCL1 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Pram1Q6BCL1 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
Pram1Q6BCL1 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Pram1Q6BCL1 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.3 ms