Protein–RNA interactions for Protein: Q6A028

Swap70, Switch-associated protein 70, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 585 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Swap70Q6A028 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Swap70Q6A028 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Swap70Q6A028 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Swap70Q6A028 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Swap70Q6A028 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Swap70Q6A028 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Swap70Q6A028 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Swap70Q6A028 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Swap70Q6A028 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Swap70Q6A028 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Swap70Q6A028 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Swap70Q6A028 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Swap70Q6A028 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Swap70Q6A028 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Swap70Q6A028 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Swap70Q6A028 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Swap70Q6A028 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Swap70Q6A028 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Swap70Q6A028 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Swap70Q6A028 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Swap70Q6A028 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Swap70Q6A028 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Swap70Q6A028 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Swap70Q6A028 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Swap70Q6A028 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Swap70Q6A028 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Swap70Q6A028 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Swap70Q6A028 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Swap70Q6A028 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Swap70Q6A028 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Swap70Q6A028 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Swap70Q6A028 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Swap70Q6A028 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Swap70Q6A028 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Swap70Q6A028 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Swap70Q6A028 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Swap70Q6A028 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Swap70Q6A028 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Swap70Q6A028 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Swap70Q6A028 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Swap70Q6A028 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Swap70Q6A028 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Swap70Q6A028 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Swap70Q6A028 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Swap70Q6A028 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Swap70Q6A028 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Swap70Q6A028 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Swap70Q6A028 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Swap70Q6A028 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Swap70Q6A028 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Swap70Q6A028 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Swap70Q6A028 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Swap70Q6A028 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Swap70Q6A028 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Swap70Q6A028 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Swap70Q6A028 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Swap70Q6A028 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Swap70Q6A028 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Swap70Q6A028 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Swap70Q6A028 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Swap70Q6A028 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Swap70Q6A028 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Swap70Q6A028 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Swap70Q6A028 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Swap70Q6A028 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Swap70Q6A028 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
Swap70Q6A028 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Swap70Q6A028 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Swap70Q6A028 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Swap70Q6A028 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Swap70Q6A028 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Swap70Q6A028 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Swap70Q6A028 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Swap70Q6A028 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Swap70Q6A028 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Swap70Q6A028 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Swap70Q6A028 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Swap70Q6A028 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Swap70Q6A028 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Swap70Q6A028 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Swap70Q6A028 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Swap70Q6A028 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Swap70Q6A028 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Swap70Q6A028 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Swap70Q6A028 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Swap70Q6A028 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Swap70Q6A028 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Swap70Q6A028 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Swap70Q6A028 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Swap70Q6A028 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Swap70Q6A028 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Swap70Q6A028 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Swap70Q6A028 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Swap70Q6A028 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Swap70Q6A028 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Swap70Q6A028 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Swap70Q6A028 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Swap70Q6A028 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Swap70Q6A028 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Swap70Q6A028 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.7 ms