Protein–RNA interactions for Protein: Q68FD9

Kiaa1549, UPF0606 protein KIAA1549, mousemouse

Predictions only

Length 1,940 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kiaa1549Q68FD9 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Kiaa1549Q68FD9 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Kiaa1549Q68FD9 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Kiaa1549Q68FD9 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Kiaa1549Q68FD9 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Kiaa1549Q68FD9 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Kiaa1549Q68FD9 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Kiaa1549Q68FD9 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Kiaa1549Q68FD9 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Kiaa1549Q68FD9 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Kiaa1549Q68FD9 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Kiaa1549Q68FD9 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Kiaa1549Q68FD9 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Kiaa1549Q68FD9 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Kiaa1549Q68FD9 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Kiaa1549Q68FD9 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Kiaa1549Q68FD9 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Kiaa1549Q68FD9 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Kiaa1549Q68FD9 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Kiaa1549Q68FD9 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Kiaa1549Q68FD9 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Kiaa1549Q68FD9 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Kiaa1549Q68FD9 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Kiaa1549Q68FD9 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Kiaa1549Q68FD9 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Kiaa1549Q68FD9 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Kiaa1549Q68FD9 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Kiaa1549Q68FD9 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Kiaa1549Q68FD9 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Kiaa1549Q68FD9 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Kiaa1549Q68FD9 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Kiaa1549Q68FD9 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Kiaa1549Q68FD9 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Kiaa1549Q68FD9 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Kiaa1549Q68FD9 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Kiaa1549Q68FD9 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Kiaa1549Q68FD9 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Kiaa1549Q68FD9 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Kiaa1549Q68FD9 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Kiaa1549Q68FD9 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Kiaa1549Q68FD9 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Kiaa1549Q68FD9 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Kiaa1549Q68FD9 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Kiaa1549Q68FD9 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Kiaa1549Q68FD9 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Kiaa1549Q68FD9 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Kiaa1549Q68FD9 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Kiaa1549Q68FD9 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Kiaa1549Q68FD9 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Kiaa1549Q68FD9 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Kiaa1549Q68FD9 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Kiaa1549Q68FD9 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Kiaa1549Q68FD9 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Kiaa1549Q68FD9 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Kiaa1549Q68FD9 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Kiaa1549Q68FD9 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Kiaa1549Q68FD9 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Kiaa1549Q68FD9 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Kiaa1549Q68FD9 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Kiaa1549Q68FD9 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Kiaa1549Q68FD9 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Kiaa1549Q68FD9 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Kiaa1549Q68FD9 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Kiaa1549Q68FD9 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Kiaa1549Q68FD9 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Kiaa1549Q68FD9 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Kiaa1549Q68FD9 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Kiaa1549Q68FD9 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Kiaa1549Q68FD9 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Kiaa1549Q68FD9 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Kiaa1549Q68FD9 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Kiaa1549Q68FD9 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Kiaa1549Q68FD9 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Kiaa1549Q68FD9 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Kiaa1549Q68FD9 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Kiaa1549Q68FD9 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Kiaa1549Q68FD9 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Kiaa1549Q68FD9 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Kiaa1549Q68FD9 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Kiaa1549Q68FD9 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Kiaa1549Q68FD9 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Kiaa1549Q68FD9 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Kiaa1549Q68FD9 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Kiaa1549Q68FD9 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Kiaa1549Q68FD9 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Kiaa1549Q68FD9 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Kiaa1549Q68FD9 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Kiaa1549Q68FD9 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Kiaa1549Q68FD9 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Kiaa1549Q68FD9 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Kiaa1549Q68FD9 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Kiaa1549Q68FD9 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Kiaa1549Q68FD9 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Kiaa1549Q68FD9 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Kiaa1549Q68FD9 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Kiaa1549Q68FD9 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Kiaa1549Q68FD9 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Kiaa1549Q68FD9 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Kiaa1549Q68FD9 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Kiaa1549Q68FD9 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.8 ms