Protein–RNA interactions for Protein: Q64487

Ptprd, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase delta, mousemouse

Predictions only

Length 1,912 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprdQ64487 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
PtprdQ64487 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
PtprdQ64487 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PtprdQ64487 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PtprdQ64487 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PtprdQ64487 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
PtprdQ64487 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PtprdQ64487 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
PtprdQ64487 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
PtprdQ64487 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
PtprdQ64487 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
PtprdQ64487 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
PtprdQ64487 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC19.69■□□□□ 0.74
PtprdQ64487 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
PtprdQ64487 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
PtprdQ64487 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
PtprdQ64487 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC19.68■□□□□ 0.74
PtprdQ64487 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
PtprdQ64487 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
PtprdQ64487 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
PtprdQ64487 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
PtprdQ64487 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
PtprdQ64487 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
PtprdQ64487 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
PtprdQ64487 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
PtprdQ64487 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
PtprdQ64487 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
PtprdQ64487 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
PtprdQ64487 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
PtprdQ64487 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
PtprdQ64487 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
PtprdQ64487 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
PtprdQ64487 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
PtprdQ64487 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
PtprdQ64487 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
PtprdQ64487 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
PtprdQ64487 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
PtprdQ64487 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
PtprdQ64487 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
PtprdQ64487 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
PtprdQ64487 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
PtprdQ64487 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC19.67■□□□□ 0.74
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PtprdQ64487 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
PtprdQ64487 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PtprdQ64487 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PtprdQ64487 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PtprdQ64487 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PtprdQ64487 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
PtprdQ64487 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PtprdQ64487 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PtprdQ64487 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PtprdQ64487 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PtprdQ64487 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PtprdQ64487 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
PtprdQ64487 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
PtprdQ64487 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PtprdQ64487 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
PtprdQ64487 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PtprdQ64487 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
PtprdQ64487 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
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PtprdQ64487 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
PtprdQ64487 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
PtprdQ64487 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
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PtprdQ64487 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
PtprdQ64487 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
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PtprdQ64487 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PtprdQ64487 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC19.63■□□□□ 0.73
PtprdQ64487 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PtprdQ64487 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
PtprdQ64487 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PtprdQ64487 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC19.63■□□□□ 0.73
PtprdQ64487 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
PtprdQ64487 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PtprdQ64487 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PtprdQ64487 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
PtprdQ64487 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PtprdQ64487 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PtprdQ64487 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PtprdQ64487 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PtprdQ64487 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
PtprdQ64487 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
PtprdQ64487 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
PtprdQ64487 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
PtprdQ64487 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
PtprdQ64487 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PtprdQ64487 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PtprdQ64487 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PtprdQ64487 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PtprdQ64487 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PtprdQ64487 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PtprdQ64487 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PtprdQ64487 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PtprdQ64487 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
PtprdQ64487 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PtprdQ64487 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms