Protein–RNA interactions for Protein: Q64016

Defa17, Alpha-defensin 17 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 82 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa17Q64016 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Defa17Q64016 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Defa17Q64016 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Defa17Q64016 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Defa17Q64016 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Defa17Q64016 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Defa17Q64016 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Defa17Q64016 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
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Defa17Q64016 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Defa17Q64016 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
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Defa17Q64016 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Defa17Q64016 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Defa17Q64016 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Defa17Q64016 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Defa17Q64016 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Defa17Q64016 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Defa17Q64016 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Defa17Q64016 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Defa17Q64016 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Defa17Q64016 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Defa17Q64016 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Defa17Q64016 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Defa17Q64016 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Defa17Q64016 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Defa17Q64016 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Defa17Q64016 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Defa17Q64016 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Defa17Q64016 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Defa17Q64016 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Defa17Q64016 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Defa17Q64016 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Defa17Q64016 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Defa17Q64016 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Defa17Q64016 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Defa17Q64016 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Defa17Q64016 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Defa17Q64016 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Defa17Q64016 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Defa17Q64016 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Defa17Q64016 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Defa17Q64016 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Defa17Q64016 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Defa17Q64016 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Defa17Q64016 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Defa17Q64016 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Defa17Q64016 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Defa17Q64016 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Defa17Q64016 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Defa17Q64016 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Defa17Q64016 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Defa17Q64016 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Defa17Q64016 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Defa17Q64016 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
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Defa17Q64016 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Defa17Q64016 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Defa17Q64016 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Defa17Q64016 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Defa17Q64016 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Defa17Q64016 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Defa17Q64016 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Defa17Q64016 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Defa17Q64016 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Defa17Q64016 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Defa17Q64016 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Defa17Q64016 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
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Defa17Q64016 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
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Defa17Q64016 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Defa17Q64016 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Defa17Q64016 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Defa17Q64016 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Defa17Q64016 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Defa17Q64016 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Defa17Q64016 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Defa17Q64016 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Defa17Q64016 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Defa17Q64016 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Defa17Q64016 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Defa17Q64016 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Defa17Q64016 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Defa17Q64016 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Defa17Q64016 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Defa17Q64016 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Defa17Q64016 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Defa17Q64016 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Defa17Q64016 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Defa17Q64016 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Defa17Q64016 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Defa17Q64016 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Defa17Q64016 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Defa17Q64016 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Defa17Q64016 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Defa17Q64016 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Defa17Q64016 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Defa17Q64016 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 91.8 ms