Protein–RNA interactions for Protein: Q63ZW7

Patj, InaD-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,834 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PatjQ63ZW7 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PatjQ63ZW7 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PatjQ63ZW7 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
PatjQ63ZW7 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PatjQ63ZW7 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PatjQ63ZW7 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
PatjQ63ZW7 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PatjQ63ZW7 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
PatjQ63ZW7 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PatjQ63ZW7 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PatjQ63ZW7 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PatjQ63ZW7 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PatjQ63ZW7 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PatjQ63ZW7 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PatjQ63ZW7 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PatjQ63ZW7 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PatjQ63ZW7 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PatjQ63ZW7 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PatjQ63ZW7 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
PatjQ63ZW7 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PatjQ63ZW7 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PatjQ63ZW7 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PatjQ63ZW7 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PatjQ63ZW7 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PatjQ63ZW7 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PatjQ63ZW7 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PatjQ63ZW7 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PatjQ63ZW7 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PatjQ63ZW7 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PatjQ63ZW7 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PatjQ63ZW7 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PatjQ63ZW7 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PatjQ63ZW7 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
PatjQ63ZW7 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PatjQ63ZW7 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PatjQ63ZW7 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PatjQ63ZW7 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PatjQ63ZW7 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PatjQ63ZW7 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PatjQ63ZW7 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
PatjQ63ZW7 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PatjQ63ZW7 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PatjQ63ZW7 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
PatjQ63ZW7 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PatjQ63ZW7 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PatjQ63ZW7 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PatjQ63ZW7 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PatjQ63ZW7 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
PatjQ63ZW7 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
PatjQ63ZW7 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PatjQ63ZW7 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PatjQ63ZW7 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PatjQ63ZW7 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PatjQ63ZW7 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PatjQ63ZW7 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
PatjQ63ZW7 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PatjQ63ZW7 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PatjQ63ZW7 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PatjQ63ZW7 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PatjQ63ZW7 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
PatjQ63ZW7 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PatjQ63ZW7 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PatjQ63ZW7 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PatjQ63ZW7 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PatjQ63ZW7 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PatjQ63ZW7 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
PatjQ63ZW7 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
PatjQ63ZW7 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
PatjQ63ZW7 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
PatjQ63ZW7 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
PatjQ63ZW7 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
PatjQ63ZW7 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PatjQ63ZW7 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PatjQ63ZW7 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PatjQ63ZW7 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PatjQ63ZW7 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PatjQ63ZW7 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PatjQ63ZW7 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PatjQ63ZW7 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PatjQ63ZW7 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PatjQ63ZW7 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PatjQ63ZW7 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PatjQ63ZW7 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PatjQ63ZW7 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PatjQ63ZW7 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PatjQ63ZW7 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PatjQ63ZW7 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PatjQ63ZW7 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PatjQ63ZW7 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PatjQ63ZW7 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PatjQ63ZW7 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
PatjQ63ZW7 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PatjQ63ZW7 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PatjQ63ZW7 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PatjQ63ZW7 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PatjQ63ZW7 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PatjQ63ZW7 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PatjQ63ZW7 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PatjQ63ZW7 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PatjQ63ZW7 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38 ms