Protein–RNA interactions for Protein: Q63955

Pou4f3, POU domain, class 4, transcription factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 338 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou4f3Q63955 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Pou4f3Q63955 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Pou4f3Q63955 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Pou4f3Q63955 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Pou4f3Q63955 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Pou4f3Q63955 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Pou4f3Q63955 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Pou4f3Q63955 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Pou4f3Q63955 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Pou4f3Q63955 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Pou4f3Q63955 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Pou4f3Q63955 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Pou4f3Q63955 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Pou4f3Q63955 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Pou4f3Q63955 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Pou4f3Q63955 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Pou4f3Q63955 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Pou4f3Q63955 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Pou4f3Q63955 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Pou4f3Q63955 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Pou4f3Q63955 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Pou4f3Q63955 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Pou4f3Q63955 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Pou4f3Q63955 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Pou4f3Q63955 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Pou4f3Q63955 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Pou4f3Q63955 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Pou4f3Q63955 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Pou4f3Q63955 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Pou4f3Q63955 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Pou4f3Q63955 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Pou4f3Q63955 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Pou4f3Q63955 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Pou4f3Q63955 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Pou4f3Q63955 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Pou4f3Q63955 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Pou4f3Q63955 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Pou4f3Q63955 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Pou4f3Q63955 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Pou4f3Q63955 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Pou4f3Q63955 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Pou4f3Q63955 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Pou4f3Q63955 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Pou4f3Q63955 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Pou4f3Q63955 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Pou4f3Q63955 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Pou4f3Q63955 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Pou4f3Q63955 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Pou4f3Q63955 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Pou4f3Q63955 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Pou4f3Q63955 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Pou4f3Q63955 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Pou4f3Q63955 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pou4f3Q63955 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pou4f3Q63955 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pou4f3Q63955 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pou4f3Q63955 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pou4f3Q63955 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pou4f3Q63955 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pou4f3Q63955 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pou4f3Q63955 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pou4f3Q63955 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pou4f3Q63955 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pou4f3Q63955 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pou4f3Q63955 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Pou4f3Q63955 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pou4f3Q63955 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pou4f3Q63955 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pou4f3Q63955 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pou4f3Q63955 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pou4f3Q63955 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pou4f3Q63955 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pou4f3Q63955 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pou4f3Q63955 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pou4f3Q63955 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pou4f3Q63955 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pou4f3Q63955 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pou4f3Q63955 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pou4f3Q63955 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pou4f3Q63955 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Pou4f3Q63955 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Pou4f3Q63955 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Pou4f3Q63955 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Pou4f3Q63955 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Pou4f3Q63955 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Pou4f3Q63955 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Pou4f3Q63955 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Pou4f3Q63955 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Pou4f3Q63955 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Pou4f3Q63955 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Pou4f3Q63955 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Pou4f3Q63955 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Pou4f3Q63955 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Pou4f3Q63955 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Pou4f3Q63955 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Pou4f3Q63955 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Pou4f3Q63955 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Pou4f3Q63955 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Pou4f3Q63955 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Pou4f3Q63955 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms