Protein–RNA interactions for Protein: Q62468

Vil1, Villin-1, mousemouse

Predictions only

Length 827 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vil1Q62468 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Vil1Q62468 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Vil1Q62468 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Vil1Q62468 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Vil1Q62468 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Vil1Q62468 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Vil1Q62468 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Vil1Q62468 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Vil1Q62468 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Vil1Q62468 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Vil1Q62468 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Vil1Q62468 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Vil1Q62468 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Vil1Q62468 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Vil1Q62468 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Vil1Q62468 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Vil1Q62468 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Vil1Q62468 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Vil1Q62468 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Vil1Q62468 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Vil1Q62468 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Vil1Q62468 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Vil1Q62468 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Vil1Q62468 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Vil1Q62468 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Vil1Q62468 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Vil1Q62468 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Vil1Q62468 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Vil1Q62468 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Vil1Q62468 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Vil1Q62468 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Vil1Q62468 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Vil1Q62468 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Vil1Q62468 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Vil1Q62468 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Vil1Q62468 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Vil1Q62468 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Vil1Q62468 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Vil1Q62468 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Vil1Q62468 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Vil1Q62468 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Vil1Q62468 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Vil1Q62468 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Vil1Q62468 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Vil1Q62468 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Vil1Q62468 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Vil1Q62468 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Vil1Q62468 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Vil1Q62468 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Vil1Q62468 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Vil1Q62468 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Vil1Q62468 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Vil1Q62468 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Vil1Q62468 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Vil1Q62468 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Vil1Q62468 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Vil1Q62468 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Vil1Q62468 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Vil1Q62468 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Vil1Q62468 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Vil1Q62468 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Vil1Q62468 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Vil1Q62468 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Vil1Q62468 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Vil1Q62468 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Vil1Q62468 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Vil1Q62468 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Vil1Q62468 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Vil1Q62468 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Vil1Q62468 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Vil1Q62468 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Vil1Q62468 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Vil1Q62468 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Vil1Q62468 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Vil1Q62468 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Vil1Q62468 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Vil1Q62468 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Vil1Q62468 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Vil1Q62468 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Vil1Q62468 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Vil1Q62468 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Vil1Q62468 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Vil1Q62468 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Vil1Q62468 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Vil1Q62468 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Vil1Q62468 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Vil1Q62468 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Vil1Q62468 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Vil1Q62468 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Vil1Q62468 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Vil1Q62468 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Vil1Q62468 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Vil1Q62468 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Vil1Q62468 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Vil1Q62468 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Vil1Q62468 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Vil1Q62468 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Vil1Q62468 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Vil1Q62468 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Vil1Q62468 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54 ms