Protein–RNA interactions for Protein: Q62465

Vat1, Synaptic vesicle membrane protein VAT-1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vat1Q62465 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Vat1Q62465 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Vat1Q62465 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Vat1Q62465 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Vat1Q62465 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Vat1Q62465 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Vat1Q62465 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Vat1Q62465 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Vat1Q62465 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Vat1Q62465 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Vat1Q62465 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Vat1Q62465 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Vat1Q62465 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Vat1Q62465 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Vat1Q62465 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Vat1Q62465 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Vat1Q62465 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Vat1Q62465 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Vat1Q62465 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Vat1Q62465 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Vat1Q62465 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Vat1Q62465 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Vat1Q62465 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Vat1Q62465 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Vat1Q62465 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Vat1Q62465 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Vat1Q62465 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Vat1Q62465 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Vat1Q62465 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Vat1Q62465 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Vat1Q62465 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Vat1Q62465 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Vat1Q62465 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Vat1Q62465 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Vat1Q62465 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Vat1Q62465 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Vat1Q62465 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Vat1Q62465 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Vat1Q62465 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Vat1Q62465 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Vat1Q62465 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Vat1Q62465 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Vat1Q62465 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Vat1Q62465 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Vat1Q62465 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Vat1Q62465 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Vat1Q62465 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Vat1Q62465 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Vat1Q62465 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Vat1Q62465 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Vat1Q62465 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Vat1Q62465 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Vat1Q62465 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Vat1Q62465 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Vat1Q62465 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Vat1Q62465 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Vat1Q62465 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Vat1Q62465 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Vat1Q62465 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Vat1Q62465 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Vat1Q62465 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
Vat1Q62465 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
Vat1Q62465 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
Vat1Q62465 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Vat1Q62465 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
Vat1Q62465 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Vat1Q62465 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
Vat1Q62465 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Vat1Q62465 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
Vat1Q62465 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Vat1Q62465 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Vat1Q62465 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Vat1Q62465 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Vat1Q62465 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Vat1Q62465 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Vat1Q62465 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Vat1Q62465 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Vat1Q62465 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Vat1Q62465 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Vat1Q62465 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Vat1Q62465 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Vat1Q62465 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Vat1Q62465 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Vat1Q62465 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Vat1Q62465 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Vat1Q62465 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Vat1Q62465 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Vat1Q62465 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Vat1Q62465 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Vat1Q62465 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Vat1Q62465 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Vat1Q62465 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Vat1Q62465 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Vat1Q62465 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Vat1Q62465 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Vat1Q62465 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Vat1Q62465 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Vat1Q62465 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Vat1Q62465 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Vat1Q62465 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms