Protein–RNA interactions for Protein: Q62401

Ccl12, C-C motif chemokine 12, mousemouse

Predictions only

Length 104 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl12Q62401 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccl12Q62401 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccl12Q62401 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccl12Q62401 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccl12Q62401 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccl12Q62401 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccl12Q62401 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccl12Q62401 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccl12Q62401 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccl12Q62401 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccl12Q62401 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccl12Q62401 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccl12Q62401 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccl12Q62401 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccl12Q62401 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccl12Q62401 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccl12Q62401 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccl12Q62401 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccl12Q62401 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccl12Q62401 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccl12Q62401 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccl12Q62401 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccl12Q62401 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccl12Q62401 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccl12Q62401 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccl12Q62401 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccl12Q62401 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccl12Q62401 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccl12Q62401 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccl12Q62401 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccl12Q62401 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccl12Q62401 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccl12Q62401 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccl12Q62401 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccl12Q62401 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccl12Q62401 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccl12Q62401 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccl12Q62401 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccl12Q62401 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccl12Q62401 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccl12Q62401 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccl12Q62401 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccl12Q62401 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccl12Q62401 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccl12Q62401 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccl12Q62401 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccl12Q62401 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccl12Q62401 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccl12Q62401 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccl12Q62401 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccl12Q62401 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccl12Q62401 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccl12Q62401 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccl12Q62401 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccl12Q62401 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccl12Q62401 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccl12Q62401 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccl12Q62401 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccl12Q62401 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccl12Q62401 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccl12Q62401 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccl12Q62401 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccl12Q62401 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccl12Q62401 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccl12Q62401 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccl12Q62401 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccl12Q62401 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccl12Q62401 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccl12Q62401 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccl12Q62401 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccl12Q62401 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccl12Q62401 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccl12Q62401 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccl12Q62401 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccl12Q62401 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccl12Q62401 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccl12Q62401 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccl12Q62401 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccl12Q62401 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccl12Q62401 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ccl12Q62401 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ccl12Q62401 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccl12Q62401 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccl12Q62401 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccl12Q62401 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccl12Q62401 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccl12Q62401 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccl12Q62401 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccl12Q62401 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccl12Q62401 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccl12Q62401 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccl12Q62401 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccl12Q62401 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccl12Q62401 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccl12Q62401 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccl12Q62401 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccl12Q62401 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccl12Q62401 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccl12Q62401 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccl12Q62401 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms