Protein–RNA interactions for Protein: Q62398

Cnga2, Cyclic nucleotide-gated olfactory channel, mousemouse

Predictions only

Length 664 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnga2Q62398 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cnga2Q62398 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Cnga2Q62398 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cnga2Q62398 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cnga2Q62398 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cnga2Q62398 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cnga2Q62398 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cnga2Q62398 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cnga2Q62398 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cnga2Q62398 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cnga2Q62398 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cnga2Q62398 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cnga2Q62398 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Cnga2Q62398 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cnga2Q62398 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cnga2Q62398 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cnga2Q62398 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cnga2Q62398 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cnga2Q62398 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cnga2Q62398 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cnga2Q62398 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cnga2Q62398 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cnga2Q62398 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cnga2Q62398 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Cnga2Q62398 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cnga2Q62398 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cnga2Q62398 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cnga2Q62398 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Cnga2Q62398 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cnga2Q62398 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cnga2Q62398 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cnga2Q62398 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cnga2Q62398 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cnga2Q62398 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cnga2Q62398 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cnga2Q62398 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cnga2Q62398 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cnga2Q62398 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cnga2Q62398 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cnga2Q62398 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cnga2Q62398 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Cnga2Q62398 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cnga2Q62398 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Cnga2Q62398 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cnga2Q62398 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cnga2Q62398 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cnga2Q62398 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cnga2Q62398 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cnga2Q62398 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Cnga2Q62398 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cnga2Q62398 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cnga2Q62398 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Cnga2Q62398 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cnga2Q62398 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cnga2Q62398 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cnga2Q62398 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cnga2Q62398 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cnga2Q62398 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cnga2Q62398 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cnga2Q62398 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cnga2Q62398 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cnga2Q62398 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cnga2Q62398 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cnga2Q62398 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cnga2Q62398 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Cnga2Q62398 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cnga2Q62398 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cnga2Q62398 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cnga2Q62398 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cnga2Q62398 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cnga2Q62398 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cnga2Q62398 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cnga2Q62398 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cnga2Q62398 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cnga2Q62398 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cnga2Q62398 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cnga2Q62398 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Cnga2Q62398 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cnga2Q62398 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cnga2Q62398 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cnga2Q62398 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cnga2Q62398 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cnga2Q62398 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Cnga2Q62398 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Cnga2Q62398 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cnga2Q62398 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cnga2Q62398 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cnga2Q62398 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cnga2Q62398 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cnga2Q62398 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cnga2Q62398 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cnga2Q62398 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cnga2Q62398 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cnga2Q62398 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cnga2Q62398 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cnga2Q62398 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cnga2Q62398 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cnga2Q62398 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cnga2Q62398 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cnga2Q62398 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms