Protein–RNA interactions for Protein: Q62209

Sycp1, Synaptonemal complex protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 993 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sycp1Q62209 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Sycp1Q62209 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Sycp1Q62209 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Sycp1Q62209 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Sycp1Q62209 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Sycp1Q62209 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Sycp1Q62209 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Sycp1Q62209 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Sycp1Q62209 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Sycp1Q62209 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Sycp1Q62209 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Sycp1Q62209 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Sycp1Q62209 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Sycp1Q62209 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Sycp1Q62209 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Sycp1Q62209 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Sycp1Q62209 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Sycp1Q62209 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Sycp1Q62209 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Sycp1Q62209 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Sycp1Q62209 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Sycp1Q62209 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Sycp1Q62209 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Sycp1Q62209 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Sycp1Q62209 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Sycp1Q62209 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Sycp1Q62209 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Sycp1Q62209 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Sycp1Q62209 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Sycp1Q62209 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Sycp1Q62209 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Sycp1Q62209 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Sycp1Q62209 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Sycp1Q62209 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Sycp1Q62209 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Sycp1Q62209 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Sycp1Q62209 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Sycp1Q62209 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Sycp1Q62209 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Sycp1Q62209 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Sycp1Q62209 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Sycp1Q62209 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Sycp1Q62209 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Sycp1Q62209 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Sycp1Q62209 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Sycp1Q62209 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Sycp1Q62209 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Sycp1Q62209 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Sycp1Q62209 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Sycp1Q62209 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Sycp1Q62209 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Sycp1Q62209 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Sycp1Q62209 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Sycp1Q62209 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Sycp1Q62209 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Sycp1Q62209 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Sycp1Q62209 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Sycp1Q62209 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Sycp1Q62209 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Sycp1Q62209 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Sycp1Q62209 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Sycp1Q62209 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Sycp1Q62209 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Sycp1Q62209 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Sycp1Q62209 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Sycp1Q62209 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Sycp1Q62209 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Sycp1Q62209 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Sycp1Q62209 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Sycp1Q62209 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Sycp1Q62209 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Sycp1Q62209 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Sycp1Q62209 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Sycp1Q62209 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Sycp1Q62209 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Sycp1Q62209 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Sycp1Q62209 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Sycp1Q62209 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Sycp1Q62209 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Sycp1Q62209 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Sycp1Q62209 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Sycp1Q62209 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Sycp1Q62209 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Sycp1Q62209 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Sycp1Q62209 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Sycp1Q62209 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Sycp1Q62209 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Sycp1Q62209 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Sycp1Q62209 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Sycp1Q62209 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Sycp1Q62209 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Sycp1Q62209 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Sycp1Q62209 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Sycp1Q62209 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Sycp1Q62209 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Sycp1Q62209 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Sycp1Q62209 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Sycp1Q62209 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Sycp1Q62209 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Sycp1Q62209 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.6 ms