Protein–RNA interactions for Protein: Q62170

Selplg, P-selectin glycoprotein ligand 1, mousemouse

Predictions only

Length 397 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SelplgQ62170 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SelplgQ62170 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SelplgQ62170 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SelplgQ62170 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SelplgQ62170 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SelplgQ62170 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SelplgQ62170 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.03
SelplgQ62170 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SelplgQ62170 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SelplgQ62170 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SelplgQ62170 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SelplgQ62170 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SelplgQ62170 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SelplgQ62170 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SelplgQ62170 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SelplgQ62170 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SelplgQ62170 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SelplgQ62170 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
SelplgQ62170 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SelplgQ62170 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SelplgQ62170 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SelplgQ62170 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SelplgQ62170 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SelplgQ62170 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SelplgQ62170 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SelplgQ62170 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SelplgQ62170 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SelplgQ62170 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SelplgQ62170 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
SelplgQ62170 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SelplgQ62170 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SelplgQ62170 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SelplgQ62170 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SelplgQ62170 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SelplgQ62170 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SelplgQ62170 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SelplgQ62170 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SelplgQ62170 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SelplgQ62170 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SelplgQ62170 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SelplgQ62170 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SelplgQ62170 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SelplgQ62170 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SelplgQ62170 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SelplgQ62170 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SelplgQ62170 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SelplgQ62170 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SelplgQ62170 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SelplgQ62170 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SelplgQ62170 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SelplgQ62170 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SelplgQ62170 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SelplgQ62170 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SelplgQ62170 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SelplgQ62170 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SelplgQ62170 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SelplgQ62170 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SelplgQ62170 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SelplgQ62170 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SelplgQ62170 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SelplgQ62170 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SelplgQ62170 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SelplgQ62170 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SelplgQ62170 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SelplgQ62170 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SelplgQ62170 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SelplgQ62170 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SelplgQ62170 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SelplgQ62170 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SelplgQ62170 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SelplgQ62170 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SelplgQ62170 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SelplgQ62170 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SelplgQ62170 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SelplgQ62170 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SelplgQ62170 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SelplgQ62170 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SelplgQ62170 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SelplgQ62170 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SelplgQ62170 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SelplgQ62170 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SelplgQ62170 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SelplgQ62170 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SelplgQ62170 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
SelplgQ62170 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
SelplgQ62170 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
SelplgQ62170 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SelplgQ62170 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SelplgQ62170 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SelplgQ62170 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SelplgQ62170 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SelplgQ62170 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SelplgQ62170 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SelplgQ62170 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SelplgQ62170 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SelplgQ62170 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SelplgQ62170 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SelplgQ62170 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SelplgQ62170 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SelplgQ62170 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms