Protein–RNA interactions for Protein: Q62158

Trim27, Zinc finger protein RFP, mousemouse

Predictions only

Length 513 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim27Q62158 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Trim27Q62158 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Trim27Q62158 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Trim27Q62158 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Trim27Q62158 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Trim27Q62158 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Trim27Q62158 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Trim27Q62158 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC24■■□□□ 1.43
Trim27Q62158 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Trim27Q62158 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Trim27Q62158 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Trim27Q62158 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
Trim27Q62158 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Trim27Q62158 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Trim27Q62158 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Trim27Q62158 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Trim27Q62158 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Trim27Q62158 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Trim27Q62158 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Trim27Q62158 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Trim27Q62158 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Trim27Q62158 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Trim27Q62158 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Trim27Q62158 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Trim27Q62158 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Trim27Q62158 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Trim27Q62158 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Trim27Q62158 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Trim27Q62158 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Trim27Q62158 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Trim27Q62158 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Trim27Q62158 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Trim27Q62158 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Trim27Q62158 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Trim27Q62158 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Trim27Q62158 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Trim27Q62158 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Trim27Q62158 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Trim27Q62158 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Trim27Q62158 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Trim27Q62158 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Trim27Q62158 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Trim27Q62158 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Trim27Q62158 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Trim27Q62158 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
Trim27Q62158 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Trim27Q62158 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Trim27Q62158 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Trim27Q62158 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Trim27Q62158 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Trim27Q62158 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Trim27Q62158 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Trim27Q62158 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Trim27Q62158 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Trim27Q62158 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Trim27Q62158 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Trim27Q62158 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Trim27Q62158 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Trim27Q62158 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Trim27Q62158 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Trim27Q62158 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Trim27Q62158 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Trim27Q62158 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Trim27Q62158 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Trim27Q62158 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Trim27Q62158 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Trim27Q62158 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Trim27Q62158 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Trim27Q62158 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Trim27Q62158 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Trim27Q62158 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Trim27Q62158 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Trim27Q62158 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Trim27Q62158 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Trim27Q62158 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Trim27Q62158 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Trim27Q62158 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Trim27Q62158 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Trim27Q62158 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Trim27Q62158 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Trim27Q62158 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Trim27Q62158 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Trim27Q62158 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Trim27Q62158 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Trim27Q62158 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Trim27Q62158 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Trim27Q62158 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Trim27Q62158 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Trim27Q62158 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Trim27Q62158 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Trim27Q62158 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Trim27Q62158 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Trim27Q62158 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Trim27Q62158 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Trim27Q62158 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Trim27Q62158 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Trim27Q62158 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Trim27Q62158 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Trim27Q62158 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Trim27Q62158 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.9 ms