Protein–RNA interactions for Protein: Q61937

Npm1, Nucleophosmin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Npm1Q61937 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
Npm1Q61937 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
Npm1Q61937 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
Npm1Q61937 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
Npm1Q61937 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC32.23■■■□□ 2.75
Npm1Q61937 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC32.23■■■□□ 2.75
Npm1Q61937 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
Npm1Q61937 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
Npm1Q61937 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
Npm1Q61937 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC32.22■■■□□ 2.75
Npm1Q61937 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC32.22■■■□□ 2.75
Npm1Q61937 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
Npm1Q61937 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
Npm1Q61937 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC32.22■■■□□ 2.75
Npm1Q61937 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
Npm1Q61937 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
Npm1Q61937 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC32.22■■■□□ 2.75
Npm1Q61937 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
Npm1Q61937 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC32.21■■■□□ 2.75
Npm1Q61937 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC32.21■■■□□ 2.75
Npm1Q61937 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
Npm1Q61937 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
Npm1Q61937 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
Npm1Q61937 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
Npm1Q61937 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
Npm1Q61937 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC32.2■■■□□ 2.75
Npm1Q61937 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC32.2■■■□□ 2.75
Npm1Q61937 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.74
Npm1Q61937 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.74
Npm1Q61937 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
Npm1Q61937 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
Npm1Q61937 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC32.19■■■□□ 2.74
Npm1Q61937 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC32.19■■■□□ 2.74
Npm1Q61937 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC32.19■■■□□ 2.74
Npm1Q61937 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC32.19■■■□□ 2.74
Npm1Q61937 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
Npm1Q61937 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC32.19■■■□□ 2.74
Npm1Q61937 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC32.19■■■□□ 2.74
Npm1Q61937 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
Npm1Q61937 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
Npm1Q61937 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
Npm1Q61937 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
Npm1Q61937 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
Npm1Q61937 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.17■■■□□ 2.74
Npm1Q61937 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
Npm1Q61937 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
Npm1Q61937 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
Npm1Q61937 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.17■■■□□ 2.74
Npm1Q61937 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.17■■■□□ 2.74
Npm1Q61937 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.16■■■□□ 2.74
Npm1Q61937 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC32.16■■■□□ 2.74
Npm1Q61937 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
Npm1Q61937 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC32.16■■■□□ 2.74
Npm1Q61937 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
Npm1Q61937 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
Npm1Q61937 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
Npm1Q61937 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.15■■■□□ 2.74
Npm1Q61937 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.15■■■□□ 2.74
Npm1Q61937 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC32.14■■■□□ 2.74
Npm1Q61937 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
Npm1Q61937 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
Npm1Q61937 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
Npm1Q61937 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
Npm1Q61937 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC32.14■■■□□ 2.74
Npm1Q61937 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
Npm1Q61937 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
Npm1Q61937 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
Npm1Q61937 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.13■■■□□ 2.73
Npm1Q61937 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.13■■■□□ 2.73
Npm1Q61937 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
Npm1Q61937 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.12■■■□□ 2.73
Npm1Q61937 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
Npm1Q61937 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC32.12■■■□□ 2.73
Npm1Q61937 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.12■■■□□ 2.73
Npm1Q61937 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC32.12■■■□□ 2.73
Npm1Q61937 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
Npm1Q61937 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
Npm1Q61937 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
Npm1Q61937 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
Npm1Q61937 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC32.11■■■□□ 2.73
Npm1Q61937 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
Npm1Q61937 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
Npm1Q61937 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
Npm1Q61937 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
Npm1Q61937 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC32.1■■■□□ 2.73
Npm1Q61937 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
Npm1Q61937 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
Npm1Q61937 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
Npm1Q61937 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
Npm1Q61937 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC32.09■■■□□ 2.73
Npm1Q61937 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC32.09■■■□□ 2.73
Npm1Q61937 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
Npm1Q61937 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
Npm1Q61937 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.09■■■□□ 2.73
Npm1Q61937 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC32.09■■■□□ 2.73
Npm1Q61937 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
Npm1Q61937 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.08■■■□□ 2.73
Npm1Q61937 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
Npm1Q61937 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
Npm1Q61937 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms