Protein–RNA interactions for Protein: Q61897

Krt33b, Keratin, type I cuticular Ha3-II, mousemouse

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt33bQ61897 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Krt33bQ61897 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Krt33bQ61897 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Krt33bQ61897 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Krt33bQ61897 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Krt33bQ61897 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Krt33bQ61897 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Krt33bQ61897 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Krt33bQ61897 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Krt33bQ61897 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Krt33bQ61897 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Krt33bQ61897 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Krt33bQ61897 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Krt33bQ61897 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Krt33bQ61897 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Krt33bQ61897 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Krt33bQ61897 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Krt33bQ61897 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Krt33bQ61897 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Krt33bQ61897 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Krt33bQ61897 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Krt33bQ61897 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Krt33bQ61897 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Krt33bQ61897 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Krt33bQ61897 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Krt33bQ61897 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Krt33bQ61897 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Krt33bQ61897 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Krt33bQ61897 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Krt33bQ61897 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Krt33bQ61897 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Krt33bQ61897 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Krt33bQ61897 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Krt33bQ61897 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Krt33bQ61897 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Krt33bQ61897 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Krt33bQ61897 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Krt33bQ61897 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Krt33bQ61897 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Krt33bQ61897 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Krt33bQ61897 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Krt33bQ61897 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Krt33bQ61897 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Krt33bQ61897 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Krt33bQ61897 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Krt33bQ61897 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Krt33bQ61897 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Krt33bQ61897 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Krt33bQ61897 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Krt33bQ61897 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Krt33bQ61897 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Krt33bQ61897 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Krt33bQ61897 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Krt33bQ61897 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Krt33bQ61897 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Krt33bQ61897 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Krt33bQ61897 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Krt33bQ61897 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Krt33bQ61897 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Krt33bQ61897 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Krt33bQ61897 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Krt33bQ61897 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Krt33bQ61897 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Krt33bQ61897 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Krt33bQ61897 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Krt33bQ61897 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Krt33bQ61897 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Krt33bQ61897 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Krt33bQ61897 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Krt33bQ61897 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Krt33bQ61897 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Krt33bQ61897 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Krt33bQ61897 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Krt33bQ61897 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Krt33bQ61897 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Krt33bQ61897 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Krt33bQ61897 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Krt33bQ61897 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Krt33bQ61897 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Krt33bQ61897 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Krt33bQ61897 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Krt33bQ61897 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Krt33bQ61897 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Krt33bQ61897 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Krt33bQ61897 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Krt33bQ61897 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Krt33bQ61897 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Krt33bQ61897 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Krt33bQ61897 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Krt33bQ61897 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Krt33bQ61897 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Krt33bQ61897 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Krt33bQ61897 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Krt33bQ61897 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Krt33bQ61897 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Krt33bQ61897 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Krt33bQ61897 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Krt33bQ61897 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Krt33bQ61897 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Krt33bQ61897 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.2 ms