Protein–RNA interactions for Protein: Q61508

Ecm1, Extracellular matrix protein 1, mousemouse

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Length 559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ecm1Q61508 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ecm1Q61508 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ecm1Q61508 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ecm1Q61508 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ecm1Q61508 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ecm1Q61508 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ecm1Q61508 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Ecm1Q61508 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Ecm1Q61508 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ecm1Q61508 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ecm1Q61508 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ecm1Q61508 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ecm1Q61508 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ecm1Q61508 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ecm1Q61508 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ecm1Q61508 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ecm1Q61508 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Ecm1Q61508 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ecm1Q61508 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ecm1Q61508 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ecm1Q61508 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Ecm1Q61508 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ecm1Q61508 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ecm1Q61508 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ecm1Q61508 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ecm1Q61508 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ecm1Q61508 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ecm1Q61508 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ecm1Q61508 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ecm1Q61508 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ecm1Q61508 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ecm1Q61508 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ecm1Q61508 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ecm1Q61508 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ecm1Q61508 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ecm1Q61508 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ecm1Q61508 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ecm1Q61508 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ecm1Q61508 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ecm1Q61508 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ecm1Q61508 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ecm1Q61508 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ecm1Q61508 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ecm1Q61508 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ecm1Q61508 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ecm1Q61508 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ecm1Q61508 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ecm1Q61508 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ecm1Q61508 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ecm1Q61508 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ecm1Q61508 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ecm1Q61508 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ecm1Q61508 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ecm1Q61508 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ecm1Q61508 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ecm1Q61508 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ecm1Q61508 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Ecm1Q61508 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Ecm1Q61508 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ecm1Q61508 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ecm1Q61508 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ecm1Q61508 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Ecm1Q61508 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ecm1Q61508 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ecm1Q61508 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ecm1Q61508 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ecm1Q61508 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ecm1Q61508 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ecm1Q61508 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ecm1Q61508 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ecm1Q61508 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ecm1Q61508 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ecm1Q61508 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ecm1Q61508 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ecm1Q61508 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Ecm1Q61508 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ecm1Q61508 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ecm1Q61508 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ecm1Q61508 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ecm1Q61508 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ecm1Q61508 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ecm1Q61508 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ecm1Q61508 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ecm1Q61508 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ecm1Q61508 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Ecm1Q61508 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ecm1Q61508 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ecm1Q61508 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Ecm1Q61508 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ecm1Q61508 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ecm1Q61508 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ecm1Q61508 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ecm1Q61508 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Ecm1Q61508 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ecm1Q61508 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Ecm1Q61508 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Ecm1Q61508 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ecm1Q61508 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ecm1Q61508 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ecm1Q61508 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
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