Protein–RNA interactions for Protein: Q61146

Ocln, Occludin, mousemouse

Predictions only

Length 521 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OclnQ61146 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
OclnQ61146 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
OclnQ61146 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
OclnQ61146 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
OclnQ61146 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
OclnQ61146 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
OclnQ61146 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
OclnQ61146 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
OclnQ61146 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
OclnQ61146 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
OclnQ61146 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
OclnQ61146 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
OclnQ61146 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
OclnQ61146 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
OclnQ61146 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
OclnQ61146 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
OclnQ61146 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
OclnQ61146 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
OclnQ61146 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
OclnQ61146 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
OclnQ61146 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
OclnQ61146 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
OclnQ61146 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
OclnQ61146 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
OclnQ61146 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
OclnQ61146 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
OclnQ61146 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
OclnQ61146 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
OclnQ61146 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
OclnQ61146 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
OclnQ61146 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
OclnQ61146 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
OclnQ61146 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
OclnQ61146 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
OclnQ61146 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
OclnQ61146 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
OclnQ61146 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
OclnQ61146 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
OclnQ61146 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
OclnQ61146 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
OclnQ61146 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
OclnQ61146 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
OclnQ61146 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
OclnQ61146 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
OclnQ61146 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
OclnQ61146 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
OclnQ61146 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
OclnQ61146 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
OclnQ61146 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
OclnQ61146 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
OclnQ61146 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
OclnQ61146 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC18.14■□□□□ 0.5
OclnQ61146 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
OclnQ61146 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
OclnQ61146 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
OclnQ61146 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
OclnQ61146 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
OclnQ61146 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
OclnQ61146 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
OclnQ61146 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
OclnQ61146 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
OclnQ61146 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
OclnQ61146 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
OclnQ61146 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
OclnQ61146 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
OclnQ61146 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
OclnQ61146 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
OclnQ61146 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
OclnQ61146 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
OclnQ61146 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
OclnQ61146 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
OclnQ61146 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
OclnQ61146 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
OclnQ61146 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
OclnQ61146 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
OclnQ61146 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
OclnQ61146 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
OclnQ61146 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
OclnQ61146 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
OclnQ61146 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
OclnQ61146 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
OclnQ61146 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
OclnQ61146 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
OclnQ61146 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
OclnQ61146 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
OclnQ61146 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
OclnQ61146 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
OclnQ61146 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
OclnQ61146 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
OclnQ61146 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
OclnQ61146 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
OclnQ61146 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
OclnQ61146 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
OclnQ61146 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
OclnQ61146 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
OclnQ61146 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
OclnQ61146 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
OclnQ61146 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
OclnQ61146 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
OclnQ61146 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms