Protein–RNA interactions for Protein: Q60973

Rbbp7, Histone-binding protein RBBP7, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp7Q60973 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Rbbp7Q60973 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Rbbp7Q60973 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Rbbp7Q60973 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Rbbp7Q60973 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Rbbp7Q60973 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Rbbp7Q60973 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Rbbp7Q60973 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Rbbp7Q60973 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Rbbp7Q60973 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Rbbp7Q60973 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Rbbp7Q60973 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rbbp7Q60973 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rbbp7Q60973 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rbbp7Q60973 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rbbp7Q60973 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rbbp7Q60973 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rbbp7Q60973 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rbbp7Q60973 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rbbp7Q60973 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rbbp7Q60973 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rbbp7Q60973 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rbbp7Q60973 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rbbp7Q60973 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rbbp7Q60973 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rbbp7Q60973 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rbbp7Q60973 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rbbp7Q60973 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rbbp7Q60973 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rbbp7Q60973 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rbbp7Q60973 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rbbp7Q60973 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rbbp7Q60973 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Rbbp7Q60973 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rbbp7Q60973 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rbbp7Q60973 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rbbp7Q60973 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Rbbp7Q60973 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rbbp7Q60973 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rbbp7Q60973 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rbbp7Q60973 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rbbp7Q60973 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rbbp7Q60973 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rbbp7Q60973 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rbbp7Q60973 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rbbp7Q60973 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rbbp7Q60973 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rbbp7Q60973 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rbbp7Q60973 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rbbp7Q60973 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rbbp7Q60973 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Rbbp7Q60973 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rbbp7Q60973 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Rbbp7Q60973 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rbbp7Q60973 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Rbbp7Q60973 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rbbp7Q60973 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rbbp7Q60973 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rbbp7Q60973 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rbbp7Q60973 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rbbp7Q60973 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rbbp7Q60973 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rbbp7Q60973 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rbbp7Q60973 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rbbp7Q60973 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rbbp7Q60973 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rbbp7Q60973 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rbbp7Q60973 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rbbp7Q60973 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rbbp7Q60973 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rbbp7Q60973 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rbbp7Q60973 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rbbp7Q60973 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rbbp7Q60973 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rbbp7Q60973 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rbbp7Q60973 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rbbp7Q60973 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rbbp7Q60973 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rbbp7Q60973 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rbbp7Q60973 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rbbp7Q60973 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rbbp7Q60973 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rbbp7Q60973 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rbbp7Q60973 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rbbp7Q60973 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rbbp7Q60973 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rbbp7Q60973 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rbbp7Q60973 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rbbp7Q60973 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rbbp7Q60973 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rbbp7Q60973 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Rbbp7Q60973 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rbbp7Q60973 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rbbp7Q60973 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rbbp7Q60973 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rbbp7Q60973 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Rbbp7Q60973 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rbbp7Q60973 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rbbp7Q60973 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rbbp7Q60973 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.2 ms