Protein–RNA interactions for Protein: Q60960

Kpna1, Importin subunit alpha-5, mousemouse

Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kpna1Q60960 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Kpna1Q60960 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Kpna1Q60960 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Kpna1Q60960 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Kpna1Q60960 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Kpna1Q60960 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Kpna1Q60960 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Kpna1Q60960 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Kpna1Q60960 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Kpna1Q60960 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Kpna1Q60960 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Kpna1Q60960 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Kpna1Q60960 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Kpna1Q60960 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Kpna1Q60960 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Kpna1Q60960 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Kpna1Q60960 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Kpna1Q60960 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Kpna1Q60960 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Kpna1Q60960 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Kpna1Q60960 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Kpna1Q60960 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Kpna1Q60960 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Kpna1Q60960 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Kpna1Q60960 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Kpna1Q60960 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Kpna1Q60960 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Kpna1Q60960 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Kpna1Q60960 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Kpna1Q60960 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Kpna1Q60960 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Kpna1Q60960 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Kpna1Q60960 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Kpna1Q60960 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Kpna1Q60960 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Kpna1Q60960 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Kpna1Q60960 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Kpna1Q60960 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Kpna1Q60960 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Kpna1Q60960 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Kpna1Q60960 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Kpna1Q60960 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Kpna1Q60960 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Kpna1Q60960 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Kpna1Q60960 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Kpna1Q60960 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Kpna1Q60960 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Kpna1Q60960 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Kpna1Q60960 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Kpna1Q60960 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Kpna1Q60960 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Kpna1Q60960 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Kpna1Q60960 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Kpna1Q60960 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Kpna1Q60960 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Kpna1Q60960 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Kpna1Q60960 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Kpna1Q60960 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Kpna1Q60960 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Kpna1Q60960 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Kpna1Q60960 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Kpna1Q60960 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Kpna1Q60960 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Kpna1Q60960 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Kpna1Q60960 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Kpna1Q60960 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Kpna1Q60960 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Kpna1Q60960 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Kpna1Q60960 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Kpna1Q60960 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Kpna1Q60960 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Kpna1Q60960 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Kpna1Q60960 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Kpna1Q60960 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Kpna1Q60960 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Kpna1Q60960 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Kpna1Q60960 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Kpna1Q60960 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Kpna1Q60960 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Kpna1Q60960 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Kpna1Q60960 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Kpna1Q60960 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Kpna1Q60960 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Kpna1Q60960 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Kpna1Q60960 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Kpna1Q60960 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Kpna1Q60960 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Kpna1Q60960 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Kpna1Q60960 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Kpna1Q60960 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Kpna1Q60960 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Kpna1Q60960 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Kpna1Q60960 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Kpna1Q60960 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Kpna1Q60960 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Kpna1Q60960 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Kpna1Q60960 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Kpna1Q60960 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Kpna1Q60960 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Kpna1Q60960 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms