Protein–RNA interactions for Protein: Q60778

Nfkbib, NF-kappa-B inhibitor beta, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NfkbibQ60778 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NfkbibQ60778 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
NfkbibQ60778 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NfkbibQ60778 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NfkbibQ60778 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NfkbibQ60778 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NfkbibQ60778 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NfkbibQ60778 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NfkbibQ60778 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NfkbibQ60778 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NfkbibQ60778 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NfkbibQ60778 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NfkbibQ60778 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NfkbibQ60778 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
NfkbibQ60778 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
NfkbibQ60778 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NfkbibQ60778 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NfkbibQ60778 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NfkbibQ60778 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NfkbibQ60778 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NfkbibQ60778 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NfkbibQ60778 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NfkbibQ60778 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NfkbibQ60778 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NfkbibQ60778 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NfkbibQ60778 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NfkbibQ60778 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
NfkbibQ60778 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NfkbibQ60778 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NfkbibQ60778 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NfkbibQ60778 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NfkbibQ60778 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NfkbibQ60778 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NfkbibQ60778 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NfkbibQ60778 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NfkbibQ60778 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NfkbibQ60778 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NfkbibQ60778 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NfkbibQ60778 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NfkbibQ60778 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NfkbibQ60778 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NfkbibQ60778 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NfkbibQ60778 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NfkbibQ60778 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NfkbibQ60778 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NfkbibQ60778 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
NfkbibQ60778 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NfkbibQ60778 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NfkbibQ60778 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NfkbibQ60778 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NfkbibQ60778 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NfkbibQ60778 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NfkbibQ60778 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NfkbibQ60778 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NfkbibQ60778 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NfkbibQ60778 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NfkbibQ60778 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
NfkbibQ60778 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NfkbibQ60778 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NfkbibQ60778 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
NfkbibQ60778 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NfkbibQ60778 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NfkbibQ60778 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NfkbibQ60778 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NfkbibQ60778 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NfkbibQ60778 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NfkbibQ60778 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NfkbibQ60778 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NfkbibQ60778 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NfkbibQ60778 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NfkbibQ60778 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NfkbibQ60778 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NfkbibQ60778 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
NfkbibQ60778 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NfkbibQ60778 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NfkbibQ60778 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NfkbibQ60778 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NfkbibQ60778 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
NfkbibQ60778 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
NfkbibQ60778 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NfkbibQ60778 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NfkbibQ60778 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NfkbibQ60778 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NfkbibQ60778 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NfkbibQ60778 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
NfkbibQ60778 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NfkbibQ60778 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NfkbibQ60778 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NfkbibQ60778 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NfkbibQ60778 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
NfkbibQ60778 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NfkbibQ60778 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NfkbibQ60778 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NfkbibQ60778 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NfkbibQ60778 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NfkbibQ60778 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NfkbibQ60778 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NfkbibQ60778 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NfkbibQ60778 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NfkbibQ60778 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms