Protein–RNA interactions for Protein: Q60737

Csnk2a1, Casein kinase II subunit alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csnk2a1Q60737 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Csnk2a1Q60737 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Csnk2a1Q60737 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Csnk2a1Q60737 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Csnk2a1Q60737 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Csnk2a1Q60737 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Csnk2a1Q60737 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Csnk2a1Q60737 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Csnk2a1Q60737 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Csnk2a1Q60737 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Csnk2a1Q60737 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Csnk2a1Q60737 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Csnk2a1Q60737 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Csnk2a1Q60737 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Csnk2a1Q60737 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Csnk2a1Q60737 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Csnk2a1Q60737 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Csnk2a1Q60737 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Csnk2a1Q60737 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Csnk2a1Q60737 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Csnk2a1Q60737 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Csnk2a1Q60737 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Csnk2a1Q60737 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Csnk2a1Q60737 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Csnk2a1Q60737 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Csnk2a1Q60737 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Csnk2a1Q60737 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Csnk2a1Q60737 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Csnk2a1Q60737 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Csnk2a1Q60737 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Csnk2a1Q60737 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Csnk2a1Q60737 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Csnk2a1Q60737 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Csnk2a1Q60737 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Csnk2a1Q60737 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Csnk2a1Q60737 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Csnk2a1Q60737 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Csnk2a1Q60737 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Csnk2a1Q60737 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Csnk2a1Q60737 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Csnk2a1Q60737 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Csnk2a1Q60737 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Csnk2a1Q60737 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Csnk2a1Q60737 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Csnk2a1Q60737 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Csnk2a1Q60737 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Csnk2a1Q60737 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Csnk2a1Q60737 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Csnk2a1Q60737 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Csnk2a1Q60737 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Csnk2a1Q60737 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Csnk2a1Q60737 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Csnk2a1Q60737 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Csnk2a1Q60737 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Csnk2a1Q60737 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Csnk2a1Q60737 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Csnk2a1Q60737 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Csnk2a1Q60737 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Csnk2a1Q60737 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Csnk2a1Q60737 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Csnk2a1Q60737 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Csnk2a1Q60737 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Csnk2a1Q60737 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Csnk2a1Q60737 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Csnk2a1Q60737 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Csnk2a1Q60737 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Csnk2a1Q60737 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Csnk2a1Q60737 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Csnk2a1Q60737 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Csnk2a1Q60737 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Csnk2a1Q60737 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Csnk2a1Q60737 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Csnk2a1Q60737 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Csnk2a1Q60737 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Csnk2a1Q60737 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Csnk2a1Q60737 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Csnk2a1Q60737 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Csnk2a1Q60737 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Csnk2a1Q60737 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Csnk2a1Q60737 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Csnk2a1Q60737 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Csnk2a1Q60737 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Csnk2a1Q60737 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Csnk2a1Q60737 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Csnk2a1Q60737 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Csnk2a1Q60737 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Csnk2a1Q60737 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Csnk2a1Q60737 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Csnk2a1Q60737 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Csnk2a1Q60737 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Csnk2a1Q60737 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Csnk2a1Q60737 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Csnk2a1Q60737 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Csnk2a1Q60737 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Csnk2a1Q60737 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Csnk2a1Q60737 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Csnk2a1Q60737 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Csnk2a1Q60737 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Csnk2a1Q60737 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Csnk2a1Q60737 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms