Protein–RNA interactions for Protein: Q5UBV8

Tnfsf15, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 15, mousemouse

Predictions only

Length 252 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf15Q5UBV8 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tnfsf15Q5UBV8 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tnfsf15Q5UBV8 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tnfsf15Q5UBV8 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tnfsf15Q5UBV8 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tnfsf15Q5UBV8 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tnfsf15Q5UBV8 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tnfsf15Q5UBV8 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tnfsf15Q5UBV8 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tnfsf15Q5UBV8 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tnfsf15Q5UBV8 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tnfsf15Q5UBV8 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tnfsf15Q5UBV8 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tnfsf15Q5UBV8 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tnfsf15Q5UBV8 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tnfsf15Q5UBV8 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tnfsf15Q5UBV8 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tnfsf15Q5UBV8 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tnfsf15Q5UBV8 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tnfsf15Q5UBV8 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tnfsf15Q5UBV8 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tnfsf15Q5UBV8 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tnfsf15Q5UBV8 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tnfsf15Q5UBV8 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tnfsf15Q5UBV8 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tnfsf15Q5UBV8 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tnfsf15Q5UBV8 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tnfsf15Q5UBV8 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tnfsf15Q5UBV8 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tnfsf15Q5UBV8 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tnfsf15Q5UBV8 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tnfsf15Q5UBV8 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Tnfsf15Q5UBV8 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Tnfsf15Q5UBV8 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Tnfsf15Q5UBV8 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Tnfsf15Q5UBV8 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Tnfsf15Q5UBV8 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Tnfsf15Q5UBV8 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tnfsf15Q5UBV8 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tnfsf15Q5UBV8 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tnfsf15Q5UBV8 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tnfsf15Q5UBV8 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tnfsf15Q5UBV8 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tnfsf15Q5UBV8 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tnfsf15Q5UBV8 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Tnfsf15Q5UBV8 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tnfsf15Q5UBV8 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tnfsf15Q5UBV8 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Tnfsf15Q5UBV8 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tnfsf15Q5UBV8 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tnfsf15Q5UBV8 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tnfsf15Q5UBV8 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tnfsf15Q5UBV8 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tnfsf15Q5UBV8 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tnfsf15Q5UBV8 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tnfsf15Q5UBV8 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tnfsf15Q5UBV8 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Tnfsf15Q5UBV8 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tnfsf15Q5UBV8 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tnfsf15Q5UBV8 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tnfsf15Q5UBV8 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tnfsf15Q5UBV8 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tnfsf15Q5UBV8 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tnfsf15Q5UBV8 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tnfsf15Q5UBV8 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tnfsf15Q5UBV8 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tnfsf15Q5UBV8 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tnfsf15Q5UBV8 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tnfsf15Q5UBV8 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tnfsf15Q5UBV8 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tnfsf15Q5UBV8 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Tnfsf15Q5UBV8 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Tnfsf15Q5UBV8 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tnfsf15Q5UBV8 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tnfsf15Q5UBV8 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tnfsf15Q5UBV8 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Tnfsf15Q5UBV8 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tnfsf15Q5UBV8 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tnfsf15Q5UBV8 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tnfsf15Q5UBV8 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tnfsf15Q5UBV8 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tnfsf15Q5UBV8 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tnfsf15Q5UBV8 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tnfsf15Q5UBV8 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tnfsf15Q5UBV8 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tnfsf15Q5UBV8 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tnfsf15Q5UBV8 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Tnfsf15Q5UBV8 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tnfsf15Q5UBV8 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tnfsf15Q5UBV8 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tnfsf15Q5UBV8 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tnfsf15Q5UBV8 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tnfsf15Q5UBV8 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tnfsf15Q5UBV8 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tnfsf15Q5UBV8 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Tnfsf15Q5UBV8 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tnfsf15Q5UBV8 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tnfsf15Q5UBV8 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tnfsf15Q5UBV8 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tnfsf15Q5UBV8 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms