Protein–RNA interactions for Protein: Q5U4D8

Slc5a6, Sodium-dependent multivitamin transporter, mousemouse

Predictions only

Length 634 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc5a6Q5U4D8 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Slc5a6Q5U4D8 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Slc5a6Q5U4D8 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Slc5a6Q5U4D8 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Slc5a6Q5U4D8 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Slc5a6Q5U4D8 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Slc5a6Q5U4D8 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Slc5a6Q5U4D8 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Slc5a6Q5U4D8 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Slc5a6Q5U4D8 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Slc5a6Q5U4D8 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Slc5a6Q5U4D8 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Slc5a6Q5U4D8 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Slc5a6Q5U4D8 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Slc5a6Q5U4D8 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Slc5a6Q5U4D8 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Slc5a6Q5U4D8 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Slc5a6Q5U4D8 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Slc5a6Q5U4D8 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Slc5a6Q5U4D8 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Slc5a6Q5U4D8 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Slc5a6Q5U4D8 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Slc5a6Q5U4D8 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Slc5a6Q5U4D8 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Slc5a6Q5U4D8 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Slc5a6Q5U4D8 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Slc5a6Q5U4D8 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Slc5a6Q5U4D8 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.46
Slc5a6Q5U4D8 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Slc5a6Q5U4D8 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Slc5a6Q5U4D8 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Slc5a6Q5U4D8 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Slc5a6Q5U4D8 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Slc5a6Q5U4D8 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Slc5a6Q5U4D8 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Slc5a6Q5U4D8 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Slc5a6Q5U4D8 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Slc5a6Q5U4D8 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Slc5a6Q5U4D8 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Slc5a6Q5U4D8 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Slc5a6Q5U4D8 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Slc5a6Q5U4D8 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Slc5a6Q5U4D8 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Slc5a6Q5U4D8 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Slc5a6Q5U4D8 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Slc5a6Q5U4D8 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Slc5a6Q5U4D8 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Slc5a6Q5U4D8 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Slc5a6Q5U4D8 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Slc5a6Q5U4D8 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Slc5a6Q5U4D8 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Slc5a6Q5U4D8 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Slc5a6Q5U4D8 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Slc5a6Q5U4D8 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Slc5a6Q5U4D8 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Slc5a6Q5U4D8 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Slc5a6Q5U4D8 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Slc5a6Q5U4D8 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Slc5a6Q5U4D8 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Slc5a6Q5U4D8 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Slc5a6Q5U4D8 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Slc5a6Q5U4D8 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Slc5a6Q5U4D8 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Slc5a6Q5U4D8 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Slc5a6Q5U4D8 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Slc5a6Q5U4D8 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Slc5a6Q5U4D8 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Slc5a6Q5U4D8 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Slc5a6Q5U4D8 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Slc5a6Q5U4D8 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Slc5a6Q5U4D8 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Slc5a6Q5U4D8 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Slc5a6Q5U4D8 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Slc5a6Q5U4D8 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Slc5a6Q5U4D8 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Slc5a6Q5U4D8 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Slc5a6Q5U4D8 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Slc5a6Q5U4D8 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Slc5a6Q5U4D8 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Slc5a6Q5U4D8 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Slc5a6Q5U4D8 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Slc5a6Q5U4D8 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Slc5a6Q5U4D8 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Slc5a6Q5U4D8 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Slc5a6Q5U4D8 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Slc5a6Q5U4D8 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Slc5a6Q5U4D8 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Slc5a6Q5U4D8 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Slc5a6Q5U4D8 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Slc5a6Q5U4D8 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Slc5a6Q5U4D8 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Slc5a6Q5U4D8 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Slc5a6Q5U4D8 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Slc5a6Q5U4D8 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Slc5a6Q5U4D8 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Slc5a6Q5U4D8 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Slc5a6Q5U4D8 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Slc5a6Q5U4D8 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Slc5a6Q5U4D8 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Slc5a6Q5U4D8 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.4 ms