Protein–RNA interactions for Protein: Q5SUR0

Pfas, Phosphoribosylformylglycinamidine synthase, mousemouse

Predictions only

Length 1,337 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PfasQ5SUR0 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PfasQ5SUR0 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PfasQ5SUR0 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PfasQ5SUR0 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PfasQ5SUR0 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PfasQ5SUR0 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PfasQ5SUR0 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PfasQ5SUR0 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PfasQ5SUR0 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PfasQ5SUR0 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
PfasQ5SUR0 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PfasQ5SUR0 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PfasQ5SUR0 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PfasQ5SUR0 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PfasQ5SUR0 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PfasQ5SUR0 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PfasQ5SUR0 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PfasQ5SUR0 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PfasQ5SUR0 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PfasQ5SUR0 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PfasQ5SUR0 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PfasQ5SUR0 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PfasQ5SUR0 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PfasQ5SUR0 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PfasQ5SUR0 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PfasQ5SUR0 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PfasQ5SUR0 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PfasQ5SUR0 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PfasQ5SUR0 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PfasQ5SUR0 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PfasQ5SUR0 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PfasQ5SUR0 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PfasQ5SUR0 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PfasQ5SUR0 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PfasQ5SUR0 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PfasQ5SUR0 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PfasQ5SUR0 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PfasQ5SUR0 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PfasQ5SUR0 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PfasQ5SUR0 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PfasQ5SUR0 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PfasQ5SUR0 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PfasQ5SUR0 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PfasQ5SUR0 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PfasQ5SUR0 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PfasQ5SUR0 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PfasQ5SUR0 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PfasQ5SUR0 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PfasQ5SUR0 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
PfasQ5SUR0 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PfasQ5SUR0 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PfasQ5SUR0 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PfasQ5SUR0 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PfasQ5SUR0 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PfasQ5SUR0 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PfasQ5SUR0 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PfasQ5SUR0 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PfasQ5SUR0 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PfasQ5SUR0 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PfasQ5SUR0 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PfasQ5SUR0 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PfasQ5SUR0 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PfasQ5SUR0 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.14
PfasQ5SUR0 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
PfasQ5SUR0 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.14
PfasQ5SUR0 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PfasQ5SUR0 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PfasQ5SUR0 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PfasQ5SUR0 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PfasQ5SUR0 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PfasQ5SUR0 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PfasQ5SUR0 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PfasQ5SUR0 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PfasQ5SUR0 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PfasQ5SUR0 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PfasQ5SUR0 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PfasQ5SUR0 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PfasQ5SUR0 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PfasQ5SUR0 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PfasQ5SUR0 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PfasQ5SUR0 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PfasQ5SUR0 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PfasQ5SUR0 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PfasQ5SUR0 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PfasQ5SUR0 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PfasQ5SUR0 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PfasQ5SUR0 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PfasQ5SUR0 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PfasQ5SUR0 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PfasQ5SUR0 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PfasQ5SUR0 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PfasQ5SUR0 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PfasQ5SUR0 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PfasQ5SUR0 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
PfasQ5SUR0 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PfasQ5SUR0 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PfasQ5SUR0 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PfasQ5SUR0 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PfasQ5SUR0 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PfasQ5SUR0 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms