Protein–RNA interactions for Protein: Q5SUE8

Ankrd40, Ankyrin repeat domain-containing protein 40, mousemouse

Predictions only

Length 363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ankrd40Q5SUE8 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ankrd40Q5SUE8 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ankrd40Q5SUE8 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ankrd40Q5SUE8 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ankrd40Q5SUE8 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ankrd40Q5SUE8 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ankrd40Q5SUE8 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ankrd40Q5SUE8 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ankrd40Q5SUE8 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ankrd40Q5SUE8 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ankrd40Q5SUE8 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ankrd40Q5SUE8 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Ankrd40Q5SUE8 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Ankrd40Q5SUE8 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ankrd40Q5SUE8 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ankrd40Q5SUE8 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ankrd40Q5SUE8 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ankrd40Q5SUE8 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ankrd40Q5SUE8 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ankrd40Q5SUE8 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ankrd40Q5SUE8 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ankrd40Q5SUE8 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ankrd40Q5SUE8 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ankrd40Q5SUE8 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ankrd40Q5SUE8 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ankrd40Q5SUE8 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ankrd40Q5SUE8 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ankrd40Q5SUE8 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Ankrd40Q5SUE8 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ankrd40Q5SUE8 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ankrd40Q5SUE8 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ankrd40Q5SUE8 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ankrd40Q5SUE8 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ankrd40Q5SUE8 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ankrd40Q5SUE8 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ankrd40Q5SUE8 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ankrd40Q5SUE8 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ankrd40Q5SUE8 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ankrd40Q5SUE8 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ankrd40Q5SUE8 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ankrd40Q5SUE8 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ankrd40Q5SUE8 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ankrd40Q5SUE8 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ankrd40Q5SUE8 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ankrd40Q5SUE8 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ankrd40Q5SUE8 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ankrd40Q5SUE8 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ankrd40Q5SUE8 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ankrd40Q5SUE8 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ankrd40Q5SUE8 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ankrd40Q5SUE8 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ankrd40Q5SUE8 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ankrd40Q5SUE8 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ankrd40Q5SUE8 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ankrd40Q5SUE8 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ankrd40Q5SUE8 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ankrd40Q5SUE8 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ankrd40Q5SUE8 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ankrd40Q5SUE8 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ankrd40Q5SUE8 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ankrd40Q5SUE8 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ankrd40Q5SUE8 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ankrd40Q5SUE8 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ankrd40Q5SUE8 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ankrd40Q5SUE8 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ankrd40Q5SUE8 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Ankrd40Q5SUE8 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ankrd40Q5SUE8 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ankrd40Q5SUE8 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ankrd40Q5SUE8 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ankrd40Q5SUE8 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ankrd40Q5SUE8 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ankrd40Q5SUE8 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ankrd40Q5SUE8 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ankrd40Q5SUE8 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ankrd40Q5SUE8 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ankrd40Q5SUE8 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ankrd40Q5SUE8 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ankrd40Q5SUE8 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ankrd40Q5SUE8 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ankrd40Q5SUE8 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ankrd40Q5SUE8 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ankrd40Q5SUE8 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ankrd40Q5SUE8 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ankrd40Q5SUE8 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ankrd40Q5SUE8 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ankrd40Q5SUE8 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ankrd40Q5SUE8 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ankrd40Q5SUE8 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ankrd40Q5SUE8 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ankrd40Q5SUE8 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ankrd40Q5SUE8 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ankrd40Q5SUE8 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ankrd40Q5SUE8 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ankrd40Q5SUE8 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ankrd40Q5SUE8 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ankrd40Q5SUE8 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ankrd40Q5SUE8 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ankrd40Q5SUE8 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ankrd40Q5SUE8 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms