Protein–RNA interactions for Protein: Q5SUD9

Bbs12, Bardet-Biedl syndrome 12 protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bbs12Q5SUD9 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Bbs12Q5SUD9 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Bbs12Q5SUD9 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Bbs12Q5SUD9 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Bbs12Q5SUD9 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Bbs12Q5SUD9 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Bbs12Q5SUD9 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Bbs12Q5SUD9 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Bbs12Q5SUD9 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Bbs12Q5SUD9 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Bbs12Q5SUD9 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Bbs12Q5SUD9 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Bbs12Q5SUD9 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Bbs12Q5SUD9 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Bbs12Q5SUD9 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Bbs12Q5SUD9 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Bbs12Q5SUD9 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Bbs12Q5SUD9 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Bbs12Q5SUD9 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Bbs12Q5SUD9 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Bbs12Q5SUD9 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Bbs12Q5SUD9 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Bbs12Q5SUD9 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Bbs12Q5SUD9 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Bbs12Q5SUD9 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Bbs12Q5SUD9 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Bbs12Q5SUD9 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Bbs12Q5SUD9 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Bbs12Q5SUD9 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Bbs12Q5SUD9 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Bbs12Q5SUD9 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.38
Bbs12Q5SUD9 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Bbs12Q5SUD9 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Bbs12Q5SUD9 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Bbs12Q5SUD9 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Bbs12Q5SUD9 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Bbs12Q5SUD9 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Bbs12Q5SUD9 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Bbs12Q5SUD9 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Bbs12Q5SUD9 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Bbs12Q5SUD9 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Bbs12Q5SUD9 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Bbs12Q5SUD9 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Bbs12Q5SUD9 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Bbs12Q5SUD9 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Bbs12Q5SUD9 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Bbs12Q5SUD9 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Bbs12Q5SUD9 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Bbs12Q5SUD9 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Bbs12Q5SUD9 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Bbs12Q5SUD9 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Bbs12Q5SUD9 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Bbs12Q5SUD9 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Bbs12Q5SUD9 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Bbs12Q5SUD9 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Bbs12Q5SUD9 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Bbs12Q5SUD9 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Bbs12Q5SUD9 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Bbs12Q5SUD9 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Bbs12Q5SUD9 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Bbs12Q5SUD9 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Bbs12Q5SUD9 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Bbs12Q5SUD9 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Bbs12Q5SUD9 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Bbs12Q5SUD9 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Bbs12Q5SUD9 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Bbs12Q5SUD9 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Bbs12Q5SUD9 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Bbs12Q5SUD9 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Bbs12Q5SUD9 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Bbs12Q5SUD9 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Bbs12Q5SUD9 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Bbs12Q5SUD9 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Bbs12Q5SUD9 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Bbs12Q5SUD9 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Bbs12Q5SUD9 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Bbs12Q5SUD9 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Bbs12Q5SUD9 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Bbs12Q5SUD9 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Bbs12Q5SUD9 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Bbs12Q5SUD9 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Bbs12Q5SUD9 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Bbs12Q5SUD9 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Bbs12Q5SUD9 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Bbs12Q5SUD9 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Bbs12Q5SUD9 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Bbs12Q5SUD9 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Bbs12Q5SUD9 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Bbs12Q5SUD9 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Bbs12Q5SUD9 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Bbs12Q5SUD9 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Bbs12Q5SUD9 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Bbs12Q5SUD9 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Bbs12Q5SUD9 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Bbs12Q5SUD9 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Bbs12Q5SUD9 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Bbs12Q5SUD9 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Bbs12Q5SUD9 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Bbs12Q5SUD9 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Bbs12Q5SUD9 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms