Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSI6

Utp18, U3 small nucleolar RNA-associated protein 18 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Utp18Q5SSI6 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Utp18Q5SSI6 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Utp18Q5SSI6 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Utp18Q5SSI6 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Utp18Q5SSI6 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Utp18Q5SSI6 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Utp18Q5SSI6 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Utp18Q5SSI6 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Utp18Q5SSI6 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Utp18Q5SSI6 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Utp18Q5SSI6 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Utp18Q5SSI6 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Utp18Q5SSI6 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Utp18Q5SSI6 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Utp18Q5SSI6 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Utp18Q5SSI6 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Utp18Q5SSI6 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Utp18Q5SSI6 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Utp18Q5SSI6 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Utp18Q5SSI6 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Utp18Q5SSI6 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Utp18Q5SSI6 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Utp18Q5SSI6 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Utp18Q5SSI6 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Utp18Q5SSI6 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Utp18Q5SSI6 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Utp18Q5SSI6 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Utp18Q5SSI6 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Utp18Q5SSI6 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Utp18Q5SSI6 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Utp18Q5SSI6 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Utp18Q5SSI6 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Utp18Q5SSI6 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Utp18Q5SSI6 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Utp18Q5SSI6 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Utp18Q5SSI6 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Utp18Q5SSI6 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Utp18Q5SSI6 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Utp18Q5SSI6 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Utp18Q5SSI6 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Utp18Q5SSI6 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Utp18Q5SSI6 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Utp18Q5SSI6 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Utp18Q5SSI6 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Utp18Q5SSI6 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Utp18Q5SSI6 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Utp18Q5SSI6 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Utp18Q5SSI6 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Utp18Q5SSI6 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Utp18Q5SSI6 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Utp18Q5SSI6 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Utp18Q5SSI6 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Utp18Q5SSI6 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Utp18Q5SSI6 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Utp18Q5SSI6 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Utp18Q5SSI6 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Utp18Q5SSI6 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Utp18Q5SSI6 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Utp18Q5SSI6 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Utp18Q5SSI6 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Utp18Q5SSI6 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Utp18Q5SSI6 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Utp18Q5SSI6 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Utp18Q5SSI6 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Utp18Q5SSI6 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Utp18Q5SSI6 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Utp18Q5SSI6 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Utp18Q5SSI6 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Utp18Q5SSI6 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Utp18Q5SSI6 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Utp18Q5SSI6 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Utp18Q5SSI6 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Utp18Q5SSI6 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Utp18Q5SSI6 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Utp18Q5SSI6 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Utp18Q5SSI6 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Utp18Q5SSI6 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Utp18Q5SSI6 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Utp18Q5SSI6 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Utp18Q5SSI6 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Utp18Q5SSI6 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Utp18Q5SSI6 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Utp18Q5SSI6 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Utp18Q5SSI6 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Utp18Q5SSI6 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Utp18Q5SSI6 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Utp18Q5SSI6 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Utp18Q5SSI6 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Utp18Q5SSI6 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Utp18Q5SSI6 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Utp18Q5SSI6 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Utp18Q5SSI6 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Utp18Q5SSI6 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Utp18Q5SSI6 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Utp18Q5SSI6 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Utp18Q5SSI6 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Utp18Q5SSI6 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Utp18Q5SSI6 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Utp18Q5SSI6 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Utp18Q5SSI6 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.6 ms